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LC-MS-based metabolomics

代谢组学 鉴定(生物学) 工作流程 计算生物学 计算机科学 代谢组 生化工程 生物信息学 生物 工程类 植物 数据库
作者
Bin Zhou,Jun Xiao,Leepika Tuli,Habtom W. Ressom
出处
期刊:Molecular BioSystems [The Royal Society of Chemistry]
卷期号:8 (2): 470-481 被引量:434
标识
DOI:10.1039/c1mb05350g
摘要

Metabolomics aims at identification and quantitation of small molecules involved in metabolic reactions. LC-MS has enjoyed a growing popularity as the platform for metabolomic studies due to its high throughput, soft ionization, and good coverage of metabolites. The success of a LC-MS-based metabolomic study often depends on multiple experimental, analytical, and computational steps. This review presents a workflow of a typical LC-MS-based metabolomic analysis for identification and quantitation of metabolites indicative of biological/environmental perturbations. Challenges and current solutions in each step of the workflow are reviewed. The review intends to help investigators understand the challenges in metabolomic studies and to determine appropriate experimental, analytical, and computational methods to address these challenges.
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