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Approaches to nutritional research using organoids; fructose treatment induces epigenetic changes in liver organoids

类有机物 表观遗传学 生物 果糖 计算生物学 细胞生物学 遗传学 生物化学 基因
作者
Mirai Yamazaki,Hiroya Yamada,Eiji Munetsuna,Yoshitaka Ando,Genki Mizuno,Atsushi Teshigawara,Hayato Ichikawa,Yuki Nouchi,Itsuki Kageyama,Takuya Wakasugi,Hiroaki Ishikawa,Nobutaka Ohgami,Koji Suzuki,Koji Ohashi
出处
期刊:Journal of Nutritional Biochemistry [Elsevier BV]
卷期号:131: 109671-109671
标识
DOI:10.1016/j.jnutbio.2024.109671
摘要

Nutritional researches have successfully used animal models to gain new insights into nutrient action. However, comprehensive descriptions of their molecular mechanisms of action remain elusive as appropriate in vitro evaluation systems are lacking. Organoid models can mimic physiological structures and reproduce in vivo functions, making them increasingly utilized in biomedical research for a better understand physiological and pathological phenomena. Therefore, organoid modeling can be a powerful approach for to understand the molecular mechanisms of nutrient action. The present study aims to demonstrate the utility of organoids in nutritional research by further investigating the molecular mechanisms responsible for the negative effects of fructose intake using liver organoids. Here, we treated liver organoids with fructose and analyzed their gene expression profiles and DNA methylation levels. Microarray analysis demonstrated that fructose-treated organoids exhibited increased selenoprotein p (Sepp1) gene expression, whereas pyrosequencing assays revealed reduced DNA methylation levels in the Sepp1 region. These results were consistent with observations using hepatic tissues from fructose-fed rats. Conversely, no differences in Sepp1 mRNA and DNA methylation levels were observed in two-dimensional cells. These results suggest that organoids serve as an ideal in vitro model to recapitulate in vivo tissue responses and help to validate the molecular mechanisms of nutrient action compared to conventional cellular models.
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