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Structure of the human 80S ribosome

核糖体 真核核糖体 转移RNA 核糖体RNA 生物物理学 5.8S核糖体RNA 蛋白质生物合成 计算生物学 结构生物学 核糖体蛋白 蛋白质亚单位 A站点 细胞生物学 翻译(生物学) 化学 生物 核糖核酸 生物化学 结合位点 信使核糖核酸 基因
作者
Heena Khatter,Alexander Myasnikov,S. Kundhavai Natchiar,Bruno P. Klaholz
出处
期刊:Nature [Nature Portfolio]
卷期号:520 (7549): 640-645 被引量:473
标识
DOI:10.1038/nature14427
摘要

Ribosomes are translational machineries that catalyse protein synthesis. Ribosome structures from various species are known at the atomic level, but obtaining the structure of the human ribosome has remained a challenge; efforts to address this would be highly relevant with regard to human diseases. Here we report the near-atomic structure of the human ribosome derived from high-resolution single-particle cryo-electron microscopy and atomic model building. The structure has an average resolution of 3.6 A, reaching 2.9 A resolution in the most stable regions. It provides unprecedented insights into ribosomal RNA entities and amino acid side chains, notably of the transfer RNA binding sites and specific molecular interactions with the exit site tRNA. It reveals atomic details of the subunit interface, which is seen to remodel strongly upon rotational movements of the ribosomal subunits. Furthermore, the structure paves the way for analysing antibiotic side effects and diseases associated with deregulated protein synthesis. The structure of the human ribosome at high resolution has been solved; by combining single-particle cryo-EM and atomic model building, local resolution of 2.9 A was achieved within the most stable areas of the structure. This paper presents the near-atomic structure of the human ribosome determined using single-particle cryo-electron microscopy and atomic model building. The structure reaches the high resolution of 2.9 A in the most stable regions of the complex, allowing the visualization of previously inaccessible elements, such as regions of the ribosomal RNA scaffolding and amino acid side chains. In addition, the significant remodelling of the interface between the large and small subunits is clarified.
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