NMR-Based Configurational Assignments of Natural Products: How Floating Chirality Distance Geometry Calculations Simplify Gambling with 2N–1 Diastereomers

非对映体 手性(物理) 化学 残余物 计算化学 立体化学 算法 计算机科学 物理 量子力学 夸克 Nambu–Jona Lasinio模型 手征对称破缺
作者
Stefan Immel,Matthias Köck,Michael Reggelin
出处
期刊:Journal of Natural Products [American Chemical Society]
卷期号:85 (7): 1837-1849 被引量:3
标识
DOI:10.1021/acs.jnatprod.2c00427
摘要

Using NMR data, the assignment of the correct 3D configuration and conformation to unknown natural products is of pivotal importance in pharmaceutical and medicinal chemistry. In this report, we quantify the probability of configurational assignments to judge the quality of structural elucidations using Bayesian inference in combination with floating-chirality distance geometry simulations. Based on reference-free NOE/ROE data, residual dipolar couplings (RDCs), and residual quadrupolar couplings (RQCs) in various combinations, we demonstrate how the relative configurations of three natural compounds, namely, jatrohemiketal (1), artemisinin (2), and Taxol (3), can be unambiguously established without the necessity to carry out time-consuming DFT-based configurational and conformational analyses. Our results quantitatively describe how reliably molecular geometries can be inferred from experimental NMR data, thereby unequivocally unveiling remaining assignment ambiguities. The methodology presented here will dramatically reduce the risk of incorrect structural assignments based on the overinterpretation of incomplete data and DFT-based structure models in chemistry.
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