Hymenobacter crusticola sp. nov., isolated from biological soil crust

16S核糖体RNA 生物 系统发育树 拉伤 土壤微生物学 基因组DNA 细菌 植物 微生物学 基因 生物化学 遗传学 解剖
作者
Liang Yungang,Kai Tang,Yu Wang,Bo Yuan,Fang Tan,Fuying Feng,Huirong Liu
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:69 (2): 547-551 被引量:12
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.003196
摘要

A Gram-stain-negative, aerobic, light-pink, short rod-shaped, non-spore-forming bacterial strain was isolated from biological soil crust sampled in the Hopq Desert, Inner Mongolia, China, designated MIMBbqt21T. The G+C content of the genomic DNA was 55.1 mol%. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequence showed that strain MIMBbqt21T belonged to the genus Hymenobacter and had the highest sequence similarity to Hymenobacter cavernaeK1E01-27T (94.35 %). Cell growth could be observed at 4-29 °C (optimum, 24 °C), pH of 6.0-8.6 (optimum, 6.0) and in the presence of 1 % (w/v) NaCl (optimum, 0 %). The major fatty acids of strain MIMBbqt21T were iso-C15 : 0, C16 : 1ω5c and summed feature 3 (C16 : 1ω7c/C16 : 1ω6c). The main polar lipids were phosphatidylethanolamine, five unidentified aminophospholipids, an unidentified glycolipid and four unidentified polar lipids. The sole respiratory quinone was menaquinone MK-7. Based on the results of the phylogenetic, chemotaxonomic and phenotypic studies, strain MIMBbqt21T could be distinguished from all known Hymenobacter species and represents a novel species, for which the name Hymenobactercrusticola sp. nov. is proposed. The type strain is MIMBbqt21T (=MCCC 1K01312T=KCTC 42804T).
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