Transcriptomics analysis of Paeonia lactiflora Pall. in response to drought stress by high-throughput sequencing

WRKY蛋白质结构域 白芍 生物 转录组 遗传学 候选基因 耐旱性 Illumina染料测序 植物 DNA测序 从头转录组组装 非生物胁迫 基因 基因表达 医学 替代医学 病理
作者
Qi Wang,Yongming Fan,Jaime A. Teixeira da Silva,Xiaonan Yu
出处
期刊:Journal of Horticultural Science & Biotechnology [Taylor & Francis]
卷期号:96 (4): 479-493 被引量:2
标识
DOI:10.1080/14620316.2021.1886000
摘要

Drought is an environmental stress that limits agricultural and horticultural production worldwide. Paeonia lactiflora Pall. is a perennial flowering plant with strong environmental adaptability and a good candidate for production in arid areas. Using the Illumina Hiseq platform to study the transcriptome of P. lactiflora leaves under drought stress, 62.27 Gb of clean data was obtained and 87,099 unigenes (N50 = 1,352 bp; mean length = 790.66 bp) were obtained by transcriptome sequencing. After screening 4,198 differentially expressed genes, genes that may be related to the response of P. lactiflora to drought stress were identified: 28 signal transduction genes, 12 protein kinase genes, 14 transcription factor genes, 35 osmotic adjustment genes, 14 antioxidase enzyme genes, 22 photosynthesis genes, 9 AQP genes, 20 HSP genes, and 17 LEA genes. Transcriptomics analysis revealed that transcription factors, such as ERF, WRKY, and NAC transcription factor family members regulate the synthesis of hormones that play a role in signal transduction pathways of peony in response to drought stress. These results enrich currently available herbaceous peony gene sequence resources, fortify the identification of candidate genes and molecular regulatory mechanisms in response to drought stress, allowing genetic engineering to be used to create drought-tolerant plants.
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