Nucleic Acid Substrate-Independent DNA Polymerization on the Exosome Membrane: A Mechanism Study and Application in Exosome Analysis

化学 外体 核酸 DNA 末端脱氧核苷酸转移酶 微泡 生物化学 细胞生物学 基因 生物 细胞凋亡 小RNA 标记法
作者
Wenjiao Fan,Pihua Han,Qinya Feng,Yuanyuan Sun,Wei Ren,Tom Lawson,Chenghui Liu
出处
期刊:Analytical Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:94 (4): 2172-2179 被引量:17
标识
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04636
摘要

As generally acknowledged, terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) can only elongate DNA substrates from their 3'-OH ends. Herein, for the first time, we report that TdT-catalyzed DNA polymerization can directly proceed on the exosome membrane without the mediation of any nucleic acids. We prove that both the glycosyl and phenolic hydroxyl groups on the membrane proteins can initiate the DNA polymerization. Accordingly, we have developed powerful strategies for high-sensitive exosome profiling based on a conventional flow cytometer and an emerging CRISPR/Cas system. By using our strategy, the featured membrane protein distributions of different cancer cell-derived exosomes can be figured out, which can clearly distinguish plasma samples of breast cancer patients from those of healthy people. This work paves new ways for exosome profiling and liquid biopsy and expands the understanding of TdT, holding great significance in developing TdT-based sensing systems as well as establishing protein/nucleic acid hybrid biomaterials.
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