Network-Based Approaches for Drug Target Identification

鉴定(生物学) 药物重新定位 计算机科学 药物靶点 数据科学 药物发现 药品 重新调整用途 模式 风险分析(工程) 药物开发 人工智能 机器学习 医学 生物信息学 工程类 生物 药理学 社会科学 社会学 植物 废物管理
作者
Thodoris Koutsandreas,Kalliopi Tsafou,Heiko Horn,Ian P. Barrett,Evangelia Petsalaki
出处
期刊:Annual review of biomedical data science [Annual Reviews]
标识
DOI:10.1146/annurev-biodatasci-101424-120950
摘要

Drug target identification is the first step in drug development, and its importance is underscored by the fact that, even when using genetic evidence to improve success rates, only a small fraction of lead targets end up approved for use in the clinic. One of the reasons for this is the lack of in-depth understanding of the complexity of human diseases. In this review we argue that network-based approaches, which are able to capture relationships between relevant genes and proteins, and diverse data modalities have high potential for improving drug target identification and drug repurposing. We present the evolution of network-based methods that have been developed for this purpose and discuss the limitations of these approaches that are holding them back from making an impact in the clinic. We finish by presenting our recommendations for overcoming these limitations, for example, by leveraging emerging technologies such as artificial intelligence and knowledge graphs.
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