Effect of Calebin-A on Critical Genes Related to NAFLD: A Protein-Protein Interaction Network and Molecular Docking Study

生物 信号转导 基因 小桶 蛋白质-蛋白质相互作用 交互网络 计算生物学 对接(动物) 细胞生物学 遗传学 基因表达 基因本体论 医学 护理部
作者
Ali Mahmoudi,Mohammad Mahdi Hajihasani,Muhammed Majeed,Tannaz Jamialahmadi,Amirhossein Sahebkar
出处
期刊:Current Genomics [Bentham Science Publishers]
卷期号:25 (2): 120-139 被引量:1
标识
DOI:10.2174/0113892029280454240214072212
摘要

Background:: Calebin-A is a minor phytoconstituent of turmeric known for its activity against inflammation, oxidative stress, cancerous, and metabolic disorders like Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD). Based on bioinformatic tools. Subsequently, the details of the interaction of critical proteins with Calebin-A were investigated using the molecular docking technique. Methods:: We first probed the intersection of genes/ proteins between NAFLD and Calebin-A through online databases. Besides, we performed an enrichment analysis using the ClueGO plugin to investigate signaling pathways and gene ontology. Next, we evaluate the possible interaction of Calebin-A with significant hub proteins involved in NAFLD through a molecular docking study. Results:: We identified 87 intersection genes Calebin-A targets associated with NAFLD. PPI network analysis introduced 10 hub genes (TP53, TNF, STAT3, HSP90AA1, PTGS2, HDAC6, ABCB1, CCT2, NR1I2, and GUSB). In KEGG enrichment, most were associated with Sphingolipid, vascular endothelial growth factor A (VEGFA), C-type lectin receptor, and mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling pathways. The biological processes described in 87 intersection genes are mostly concerned with regulating the apoptotic process, cytokine production, and intracellular signal transduction. Molecular docking results also directed that Calebin-A had a high affinity to bind hub proteins linked to NAFLD. Conclusion:: Here, we showed that Calebin-A, through its effect on several critical genes/ proteins and pathways, might repress the progression of NAFLD.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
和谐觅夏完成签到,获得积分10
1秒前
无聊的老姆完成签到 ,获得积分10
1秒前
现代的从安完成签到,获得积分10
2秒前
shuoxue完成签到,获得积分20
2秒前
隐形雁山发布了新的文献求助10
2秒前
聪明伶俐的猪猪侠完成签到,获得积分10
2秒前
Ma完成签到,获得积分10
3秒前
无私妙菡完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
zhangyong发布了新的文献求助30
4秒前
5秒前
5秒前
7秒前
shuoxue发布了新的文献求助10
8秒前
8秒前
无私妙菡发布了新的文献求助10
8秒前
Profeto应助star采纳,获得10
9秒前
9秒前
Akim应助欢呼的墨镜采纳,获得10
10秒前
11秒前
leodu发布了新的文献求助10
11秒前
12秒前
12秒前
XQQDD完成签到,获得积分10
13秒前
查查完成签到,获得积分20
14秒前
changyuxin发布了新的文献求助10
15秒前
深情安青应助Jiang采纳,获得10
16秒前
思源应助顺心的筮采纳,获得10
16秒前
悦悦发布了新的文献求助10
16秒前
实验员发布了新的文献求助10
16秒前
zzz发布了新的文献求助10
17秒前
17秒前
乐乐应助HOHO采纳,获得10
18秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
18秒前
小会完成签到,获得积分10
18秒前
charlie完成签到,获得积分10
18秒前
chuanxue完成签到,获得积分10
19秒前
19秒前
Mitochondrion完成签到,获得积分10
19秒前
鱼儿发布了新的文献求助10
19秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Einführung in die Rechtsphilosophie und Rechtstheorie der Gegenwart 1500
Binary Alloy Phase Diagrams, 2nd Edition 1000
Nonthermal Processing Technologies for Food 800
青少年心理适应性量表(APAS)使用手册 700
Air Transportation A Global Management Perspective 9th Edition 700
DESIGN GUIDE FOR SHIPBOARD AIRBORNE NOISE CONTROL 600
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 内科学 生物化学 物理 计算机科学 纳米技术 遗传学 基因 复合材料 化学工程 物理化学 病理 催化作用 免疫学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4987549
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4237333
关于积分的说明 13198603
捐赠科研通 4030916
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2205215
邀请新用户注册赠送积分活动 1216850
关于科研通互助平台的介绍 1134823