Artificial intelligence for multimodal data integration in oncology

计算机科学 数据集成 医学 计算生物学 肿瘤科 癌症研究 数据挖掘 生物
作者
Jana Lipková,Richard J. Chen,Bowen Chen,Ming Y. Lu,Matteo Barbieri,Daniel Shao,Anurag Vaidya,Chengkuan Chen,Luoting Zhuang,Drew F. K. Williamson,Muhammad Shaban,Tiffany Chen,Faisal Mahmood
出处
期刊:Cancer Cell [Cell Press]
卷期号:40 (10): 1095-1110 被引量:289
标识
DOI:10.1016/j.ccell.2022.09.012
摘要

In oncology, the patient state is characterized by a whole spectrum of modalities, ranging from radiology, histology, and genomics to electronic health records. Current artificial intelligence (AI) models operate mainly in the realm of a single modality, neglecting the broader clinical context, which inevitably diminishes their potential. Integration of different data modalities provides opportunities to increase robustness and accuracy of diagnostic and prognostic models, bringing AI closer to clinical practice. AI models are also capable of discovering novel patterns within and across modalities suitable for explaining differences in patient outcomes or treatment resistance. The insights gleaned from such models can guide exploration studies and contribute to the discovery of novel biomarkers and therapeutic targets. To support these advances, here we present a synopsis of AI methods and strategies for multimodal data fusion and association discovery. We outline approaches for AI interpretability and directions for AI-driven exploration through multimodal data interconnections. We examine challenges in clinical adoption and discuss emerging solutions.
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