Role of ATF3 as a prognostic biomarker and correlation of ATF3 expression with macrophage infiltration in hepatocellular carcinoma

肝细胞癌 ATF3 渗透(HVAC) 生物标志物 癌症研究 病理 生物 医学 肿瘤科 内科学 基因表达 基因 遗传学 材料科学 发起人 复合材料
作者
Lijuan Li,Shaohua Song,Xiaoling Fang,Donglin Cao
出处
期刊:BMC Medical Genomics [BioMed Central]
卷期号:14 (1) 被引量:11
标识
DOI:10.1186/s12920-020-00852-4
摘要

The abnormal expression of activating transcription factor 3 (ATF3), a member of the basic leucine zipper (bZIP) family of transcription factors, is associated with carcinogenesis. However, the expression pattern and exact role of ATF3 in the development and progression of hepatocellular carcinoma (HCC) remain unclear.We used UALCAN, ONCOMINE, Kaplan-Meier plotter, and cBioPortal databases to investigate the prognostic value of ATF3 expression in HCC.ATF3 was found to be expressed at low levels in multiple HCC tumor tissues. Moreover, low ATF3 expression was significantly associated with clinical cancer stage and pathological tumor grade in patients with HCC. Therefore, low expression of ATF3 was significantly associated with poor overall survival in patients with HCC. Functional network analysis showed that ATF3 regulates cytokine receptors and signaling pathways via various cancer-related kinases, miRNAs, and transcription factors. ATF3 expression was found to be correlated with macrophage infiltration levels and with macrophage immune marker sets in HCC patients.Using data mining methods, we clarified the role of ATF3 expression and related regulatory networks in HCC, laying a foundation for further functional research. Future research will validate our findings and establish clinical applications of ATF3 in the diagnosis and treatment of HCC.

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