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Combining chemistry and protein engineering for new-to-nature biocatalysis

生物催化 化学 蛋白质工程 合成生物学 生化工程 纳米技术 计算机科学 定向进化 有机化学 管理科学 工程类 计算生物学 生物 催化作用 材料科学 生物化学 离子液体 突变体 基因
作者
David C. Miller,Soumitra V. Athavale,Frances H. Arnold
出处
期刊:Nature Synthesis [Springer Nature]
卷期号:1 (1): 18-23 被引量:79
标识
DOI:10.1038/s44160-021-00008-x
摘要

Biocatalysis, the application of enzymes to solve synthetic problems of human import, has blossomed into a powerful technology for chemical innovation. In the past decade, a threefold partnership, where nature provides blueprints for enzymatic catalysis, chemists introduce innovative activity modes with abiological substrates, and protein engineers develop new tools and algorithms to tune and improve enzymatic function, has unveiled the frontier of new-to-nature enzyme catalysis. In this Perspective, we highlight examples of interdisciplinary studies, which have helped to expand the scope of biocatalysis, including concepts of enzymatic versatility explored through the lens of biomimicry, to achieve activities and selectivities beyond those currently possible with chemocatalysis. We indicate how modern tools, such as directed evolution, computational protein design and machine learning-based protein engineering methods, have already impacted and will continue to influence enzyme engineering for new abiological transformations. A sustained collaborative effort across disciplines is anticipated to spur further advances in biocatalysis in the coming years. Enzymes catalyse reactions with unparalleled activity and selectivity. Using chemical insights, researchers can now direct these powerful natural catalysts to perform new-to-nature transformations that solve challenging synthetic problems. In this Perspective, we show how chemists and protein engineers have guided nature’s genetically encoded and evolvable machinery to perform new biocatalytic transformations.
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