Molecular function predictions and diagnostic value analysis of plasma exosomal miRNAs in Hirschsprung’s disease

小RNA 微泡 生物 疾病 巨结肠病 生物信息学 下调和上调 外体 计算生物学 癌症研究 基因 内科学 遗传学 医学
作者
Xiurui Lv,Yuhan Li,Hongxing Li,Lingling Zhou,Binyu Wang,Zhengke Zhi,Weibing Tang
出处
期刊:Epigenomics [Future Medicine]
卷期号:12 (5): 409-422 被引量:8
标识
DOI:10.2217/epi-2019-0190
摘要

Aim: To discover the potential roles of plasma exosomal miRNAs in Hirschsprung’s disease (HSCR) and identify potential noninvasive biomarkers for early diagnosis of HSCR. Materials & methods: Plasma samples were collected from HSCR patients and matched controls. Exosomes were isolated before high-throughput Illumina sequencing was utilized to gain a profile of dysregulated exosomal miRNAs, followed with further verification in two separate cohorts. Bioinformatics analyses were also adopted to explore the molecular functions of dysregulated miRNAs in Hirschsprung’s disease. Results & conclusion: 31 dysregulated miRNAs were identified with five considered as promising HSCR signatures. Gene enrichment analysis disclosed that the upregulated miRNAs were most likely to participate in ‘extracellular matrix–receptor interaction’ and contribute to HSCR through interfering in cell junctions.
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