Combining NMR-Based Metabolic Profiling and Genome Mining for the Accelerated Discovery of Archangiumide, an Allenic Macrolide from the Myxobacterium Archangium violaceum SDU8

计算生物学 化学 仿形(计算机编程) 基因组 基因 生物化学 生物 计算机科学 操作系统
作者
Jiaqi Hu,Jingjing Wang,Yuelan Li,Zhuo Li,Ai Zhang,Haiyan Sui,Xiaoju Li,Tao Shen,Yizhen Yin,Zhihong Wu,Wei Hu,Yuezhong Li,Changsheng Wu
出处
期刊:Organic Letters [American Chemical Society]
卷期号:23 (6): 2114-2119 被引量:16
标识
DOI:10.1021/acs.orglett.1c00265
摘要

An unprecedented 19-membered allenic macrolide archangiumide (1) was discovered from the myxobacterium Archangium violaceum SDU8 by integrating NMR-based metabolic profiling and genome mining. Its biosynthesis pathway was proposed based on the architectural analysis of the encoding trans-AT PKS genes and validated by isotope labeling. The methodology of combing 2D NMR-based metabolic profiling and bioinformatics-aided structure prediction, as exemplified by this study, is anticipated to improve discovery efficiency of a broader range of microbial "dark matter".

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