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Mass spectrometry‐based tear proteomics for noninvasive biomarker discovery

蛋白质组学 生物标志物发现 生物标志物 化学 蛋白质组 质谱法 计算生物学 鉴定(生物学) 色谱法 生物化学 植物 生物 基因
作者
Erika Ponzini,Carlo Santambrogio,Antonella De Palma,Pierluigi Mauri,Silvia Tavazzi,Rita Grandori
出处
期刊:Mass Spectrometry Reviews [Wiley]
卷期号:41 (5): 842-860 被引量:54
标识
DOI:10.1002/mas.21691
摘要

Abstract The lacrimal film has attracted increasing interest in the last decades as a potential source of biomarkers of physiopathological states, due to its accessibility, moderate complexity, and responsiveness to ocular and systemic diseases. High‐performance liquid chromatography‐mass spectrometry (LC‐MS) has led to effective approaches to tear proteomics, despite the intrinsic limitations in sample amounts. This review focuses on the recent progress in strategy and technology, with an emphasis on the potential for personalized medicine. After an introduction on lacrimal‐film composition, examples of applications to biomarker discovery are discussed, comparing approaches based on pooled‐sample and single‐tear analysis. Then, the most critical steps of the experimental pipeline, that is, tear collection, sample fractionation, and LC‐MS implementation, are discussed with reference to proteome‐coverage optimization. Advantages and challenges of the alternative procedures are highlighted. Despite the still limited number of studies, tear quantitative proteomics, including single‐tear investigation, could offer unique contributions to the identification of low‐invasiveness, sustained‐accessibility biomarkers, and to the development of personalized approaches to therapy and diagnosis.
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