Predicting MDCK cell permeation coefficients of organic molecules using membrane-interaction QSAR analysis

瞄准：使用膜相互作用量的结构活动关系分析(MI-QSAR ) 到开发在胃肠的房间有机化合物划分的预兆的模型。方法：训练的 A 将多样的混合物放 22 在结构上，犬的肾(MDCK ) 房间其越过 Madin 钞票的细胞的膜的明显的渗透被测量，被用来构造 MI-QSAR 模型。分子的动态模拟被用来与一个 dimyristoyl-phosphatidyl-choline 单层膜模型一起决定每测试混合物(溶质) 的明确的相互作用。分子内溶质描述符的一个另外的集合被计算并且为造在描述符的试用水池认为 MI-QSAR 当模特儿。QSAR 模型用多维的线性回归适合和逐步的方法被优化。8 混合物的一个测试集合作为一个确认过程的部分用 MI-QSAR 模型被评估。结果：胃肠的吸收过程的 MI-QSAR 模型被构造。在最好的 MI-QSAR 模型发现的描述符如下：1 ) ClogP (1-octanol/water 分配系数的对数) ；2 ) E (人)( 最高占据的分子的轨道的精力) ；3 ) E (段精力) ；4 ) 下午(Y)( 惯性 Y 的主要时刻，沿着在矩形的坐标的 y 轴的惯性；5 ) C (t)( 全部的连接) ；并且 6 ) E (nb )( 非结合的原子的在所有之间的相互作用的精力) 。在模型的最重要的描述符是 ClogP。结论：渗透是不仅由药分子的性质决定了，而且被分子膜相互作用过程非常也影响。