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Real-time bioelectronic sensing of environmental contaminants

生物传感器 合成生物学 纳米技术 模块化设计 生化工程 计算机科学 环境化学 化学 材料科学 计算生物学 生物 操作系统 工程类
作者
Joshua T. Atkinson,Lin Su,Xu Zhang,George N. Bennett,Jonathan J. Silberg,Caroline M. Ajo‐Franklin
出处
期刊:Nature [Springer Nature]
卷期号:611 (7936): 548-553 被引量:66
标识
DOI:10.1038/s41586-022-05356-y
摘要

Real-time chemical sensing is crucial for applications in environmental and health monitoring1. Biosensors can detect a variety of molecules through genetic circuits that use these chemicals to trigger the synthesis of a coloured protein, thereby producing an optical signal2-4. However, the process of protein expression limits the speed of this sensing to approximately half an hour, and optical signals are often difficult to detect in situ5-8. Here we combine synthetic biology and materials engineering to develop biosensors that produce electrical readouts and have detection times of minutes. We programmed Escherichia coli to produce an electrical current in response to specific chemicals using a modular, eight-component, synthetic electron transport chain. As designed, this strain produced current following exposure to thiosulfate, an anion that causes microbial blooms, within 2 min. This amperometric sensor was then modified to detect an endocrine disruptor. The incorporation of a protein switch into the synthetic pathway and encapsulation of the bacteria with conductive nanomaterials enabled the detection of the endocrine disruptor in urban waterway samples within 3 min. Our results provide design rules to sense various chemicals with mass-transport-limited detection times and a new platform for miniature, low-power bioelectronic sensors that safeguard ecological and human health.
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