Charging of tRNAs Using Ribozymes and Selection of Cyclic Peptides Containing Thioethers

硫醚 环肽 核酶 氨基酸 组合化学 半胱氨酸 化学 产量(工程) 体外 硫醇 生物化学 翻译(生物学) 立体化学 核糖核酸 材料科学 信使核糖核酸 冶金 基因
作者
Patrick Reid,Yuki Goto,Takayuki Katoh,Hiroaki Suga
出处
期刊:Methods in molecular biology [Springer Science+Business Media]
卷期号:: 335-348 被引量:26
标识
DOI:10.1007/978-1-61779-379-0_19
摘要

In vitro selection methods represent a powerful approach toward identifying high-affinity peptide ligands from highly diverse peptide libraries against a desired target. We herein describe a method for the display and selection of cyclic thioether peptide libraries. Reprogramming the initiation event from fMet to an N-chloroacetyl-amino acid by utilizing flexizyme to rapidly and efficiently prepare the aa-tRNA can be effectively used to initiate translation, upon which the thiol group of an inserted cysteine at the C terminus of the designed library spontaneously reacts to yield a nonreducible cyclic thioether peptide readily compatible with any in vitro display methods. Thus, cyclic peptides already in a nonreducible stable form can be selected directly against the target of interest.
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