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A Computationally Optimized Ribonucleic Acid Circularization Strategy without Byproducts

化学 核糖核酸 计算生物学 生物化学 组合化学 基因 生物
作者
R. Chen,Yuan Zhuang,Li Zhang,Yuanyuan Wu,Liangzhi Luo,Yufan Pan,Yujie Li,Chenyou Zhu,Rui Xu,Yifan Jiang,Ziyang Hao,Baolei Tian,Liang Zhang,Yuanchen Dong,Dongsheng Liu
出处
期刊:Journal of the American Chemical Society [American Chemical Society]
卷期号:147 (36): 32932-32940
标识
DOI:10.1021/jacs.5c09798
摘要

Circular mRNA (mRNA) exhibits promising potential in mRNA therapy due to its increased stability and extended duration of protein translation, which has sparked an urgent demand for efficient methods to prepare circular RNAs in vitro. Here, we present a versatile self-circularization strategy that employs simple motifs to synthesize circular RNAs, achieving robust efficiencies for sequences ranging from dozens to thousands of nucleotides. By leveraging an automated computational program, we optimized highly specific lock-key structures to maximize circularization efficiency, particularly for long RNA substrates. Furthermore, the shared sequence and functionality between linear precursor RNAs and circular products eliminate the need for additional purification steps to remove excess nucleic acid components, simplifying the production process. This approach also yields circular RNAs with superior stability and translation efficiency, enabling sustained protein expression in vitro and in vivo. Our computationally optimized, purification-free method holds immense promise for scalable circular RNA production and the development of advanced RNA therapeutics, significantly advancing mRNA therapy.
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