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 基于KASP分子标记的木薯种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 |
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| 其它 | 【目的】基于全基因组重测序数据开发木薯KASP分子标记，利用其对木薯种质进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建，以期为木薯种质鉴定、优异资源挖掘及新品种选育提供分子工具和理论参考。【方法】基于377份木薯种质全基因组重测序数据，以位点完整性、次要等位基因频率、杂合率、多态性信息含量（PIC）、GC含量、序列同源性、连续单碱基重复及位点分布密度等条件，筛选出高多态性KASP分子标记，并对184份木薯种质资源进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建。【结果】从木薯全基因组重测序数据中位于基因组不同位置的52722个SNP位点进行筛选，最终获得了9443个SNP位点。从木薯的18条染色体上分别选择分布相对均匀的20个SNP位点，共计360个位点。利用360对KASP引物对22份木薯种质进行引物初筛，筛选出27个高多态性KASP分子标记。通过27个KASP分子标记对184份木薯种质资源的遗传多样性分析，结果显示，主要等位基因频率（MAF）为0.440～0.842，平均为0.637；基因多样性（GD）为0.270～0.591，平均为0.464，有26个KASP分子标记的GD高于0.300；观测杂合 |
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(2025-6-4)
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