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适应性进化菌株表型不稳定,容易退化有什么办法
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152343
1
猫の傲娇
来自
江苏
,
发表于:2023-02-23 20:55:33
通过增加压力传代驯化,菌株传几代就退化了,就=愁
本帖完毕
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沙发
在水一方
站长
2023-02-24 08:58:30
发布自
乌克兰
,
适应性进化菌株的表型不稳定并且容易在压力传代驯化过程中退化,这可能是由于菌株的遗传多样性较低或者环境变化的速度过快等原因导致的。为了解决这个问题,您可以考虑以下几种方法:
提高菌株的遗传多样性:可以通过交配、基因重组或基因突变等方式增加菌株的遗传多样性,从而提高菌株的适应性和稳定性。
改变培养条件:适应性进化菌株的表型不稳定可能是由于环境变化的速度过快导致的。因此,通过逐渐增加环境压力的程度来适应菌株,或者减少环境压力的程度来让菌株恢复适应能力,可能会有所帮助。
增加传代周期:将菌株的传代周期增加到足够长的时间,可以让菌株逐渐适应环境,从而提高菌株的适应性和稳定性。
增加培养容器的大小:通过增加培养容器的大小,可以提供更多的营养物质和生长空间,从而减少菌株之间的竞争和压力,可能有助于提高菌株的适应性和稳定性。
综上所述,提高菌株的遗传多样性、改变培养条件、增加传代周期和增加培养容器的大小等方法可能有助于解决适应性进化菌株表型不稳定的问题。
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1小时前
你这个体系其实很典型:**均相金属有机络合物催化剂(homogeneous organometallic catalyst)**,而且还是高沸点、高黏度、难以获得晶体的那种。对于这类体系,很多传统固体催化剂表征(BET、SEM、TEM、PXRD)反而价值有限,真正有价值的是能够回答下面几个问题: 1. 金属中心是什么结构? 2. 配体怎么配位? 3. 金属氧化态是什么? 4. 反应过程中活性物种是否变化? 5. 是否存在聚集体、纳米颗粒或分解产物? 实际上很多均相催化论文最后都不是靠一种技术,而是靠 **NMR + MS + XAS + UV-Vis + DFT** 拼图完成的。([PMC][1]) --- # 第一层:常规结构表征 你已经做的: * FTIR * UV-Vis * XPS 除此之外最值得补的是: ## 1. NMR 如果配体有机部分比较多: ### 1H NMR 看: * 配位前后化学位移变化 * 配体是否完整 例如: P配体 ``` free ligand → 7.2 ppm coordinated → 7.8 ppm ``` 会明显移动。 --- ### 13C NMR 特别适合: * 羧酸 * 酰胺 * 吡啶 * NHC 观察配位引起的碳信号变化。 --- ### 31P NMR 如果有膦配体: 这是神器。 很多均相金属催化论文主要靠: * ^31P NMR * XAS 证明催化剂结构。 --- ### DOSY NMR 很多人忽略。 DOSY可以测扩散系数。 能判断: * 单核络合物 * 双核络合物 * 聚集体 对于高黏度液体尤其有用。 --- # 第二层:分子量和组成 ## 2. ESI-MS 对于均相催化剂几乎是必做。 看: ``` [M+H]+ [M+Na]+ [M-L]+ ``` 等等。 能够确认: * 单核 * 双核 * 配体数目 甚至反应中间体。 很多铜、铁、钴均相催化体系都这么做。([PMC][2]) --- ## 3. MALDI-TOF 如果: * 分子量大 * 黏度高 ESI不容易喷出来。 可以试: MALDI 尤其适合: * 金属簇 * 聚合型络合物 --- # 第三层:金属中心信息 这是很多人忽略但最重要的部分。 --- ## 4. XAS(XANES + EXAFS) 如果学校附近有同步辐射光源: 例如: * APS(Argonne) * NSLS-II * SSRL 那么这是最值得做的。 XAS可以直接告诉你: ### XANES 氧化态 例如: ``` Fe(II) Fe(III) ``` 区分很容易。 --- ### EXAFS 配位数 例如: ``` Fe-O = 2.01 Å Fe-N = 2.12 Å Coordination number = 6 ``` 甚至能看: * 单核 * 双核 * 金属簇 对于液体样品完全没问题。([PMC][1]) --- ## 5. EPR 如果有: * Cu(II) * Fe(III) * Mn(II) * Co(II) 非常有价值。 能直接看未成对电子。 例如很多铜催化体系就是: EPR + XAS 联合确认活性物种。([PMC][2]) --- ## 6. Mössbauer 如果是铁催化剂。 基本属于铁体系终极武器。 能区分: * Fe(II) * Fe(III) 甚至: * high-spin * low-spin --- # 第四层:热稳定性 你特别提到: > 耐高温,260℃以上 那一定值得做: ## 7. TGA 看: * 分解温度 * 配体损失 例如: ``` 200 ℃ loss = solvent 350 ℃ loss = ligand ``` --- ## 8. DSC 看: * 玻璃化温度 * 熔点 * 相变 如果是离子液体型催化剂尤其重要。 --- # 第五层:反应过程中的表征 我觉得这是你最容易发高水平文章的方向。 因为很多人只测“反应前”和“反应后”。 真正有价值的是: ## Operando UV-Vis 实时监测: ``` M(I) → M(II) → M(III) ``` 变化。 --- ## In situ FTIR 监测: * 配体变化 * 底物吸附 --- ## Operando XAS 这是目前均相催化领域的高级玩法。 因为很多催化剂: 反应前测到的结构 ≠ 真正工作的结构 XAS可以直接看反应中的活性中心。([Paul Scherrer Institute PSI][3]) --- # 第六层:如果你研究的是 DES/HDES 体系 结合你之前做的 ternary HDES work,我反而觉得下面几个技术可能特别有意思: ## Raman 比IR更容易观察: * 金属-氧 * 金属-卤素 * 氢键网络 很多离子液体和深共熔溶剂文章喜欢用。([rjpbr.com][4]) --- ## Variable-temperature NMR 看: * 氢键网络 * 配位交换 随温度变化。 --- ## Rheology 如果体系越来越黏: 测: * viscosity * storage modulus * loss modulus 有时能证明: ``` monomer → supramolecular network ``` 形成。 --- # 我如果是审稿人 对于一个“高温稳定液相金属络合物催化剂”,我最希望看到的组合是: | 问题 | 技术 | | ------ | --------------------- | | 配体是否配位 | NMR + IR | | 分子组成 | ESI-MS | | 金属氧化态 | XANES / EPR | | 配位环境 | EXAFS | | 热稳定性 | TGA/DSC | | 工作状态结构 | Operando UV-Vis 或 XAS | | 机理支持 | DFT | 如果只能再补 **3种表征**,我会优先推荐: 1. **ESI-MS** 2. **XAS(XANES/EXAFS)** 3. **Variable-temperature NMR(或DOSY NMR)** 这三种对于均相金属有机催化剂的信息增量通常远大于 SEM/TEM/XRD。尤其你这种“烘不干、拿不到晶体、一直是黏稠液体”的体系,本质上更应该按照**均相催化剂**而不是**固体材料**的思路去表征。 [1]: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4488116/?utm_source=chatgpt.com "Recent XAS studies into Homogeneous metal catalyst in fine ..." [2]: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7317854/?utm_source=chatgpt.com "Multivariate Analysis of Coupled Operando EPR/XANES ..." [3]: https://www.psi.ch/en/media/31616/download?utm_source=chatgpt.com "Operando XAFS Studies of Homogeneous and ..." [4]: https://rjpbr.com/0453-8811/article/view/660267?utm_source=chatgpt.com "Catalysts for Liquid-Phase Oxidation of Organic ..."
12小时前
虽然不多已支持
17小时前
Good good
1天前
热心小伙伴,专利可以去看看专利之星,大为专利,智慧芽等数据库哦。
1天前
培养基用什么呀请问
1天前
Good good
2天前
谢谢,现在已经好啦
2天前
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提高菌株的遗传多样性:可以通过交配、基因重组或基因突变等方式增加菌株的遗传多样性,从而提高菌株的适应性和稳定性。
改变培养条件:适应性进化菌株的表型不稳定可能是由于环境变化的速度过快导致的。因此,通过逐渐增加环境压力的程度来适应菌株,或者减少环境压力的程度来让菌株恢复适应能力,可能会有所帮助。
增加传代周期:将菌株的传代周期增加到足够长的时间,可以让菌株逐渐适应环境,从而提高菌株的适应性和稳定性。
增加培养容器的大小:通过增加培养容器的大小,可以提供更多的营养物质和生长空间,从而减少菌株之间的竞争和压力,可能有助于提高菌株的适应性和稳定性。
综上所述,提高菌株的遗传多样性、改变培养条件、增加传代周期和增加培养容器的大小等方法可能有助于解决适应性进化菌株表型不稳定的问题。