Topospro软件中如何处理2连接的“节点”?

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黎明之前失眠
黎明之前失眠 来自吉林 发表于:2025-05-01 09:56:31

在topospro软件中画拓扑结构,有的配体由于弯曲的构型形成了一个2连接的节点连接两个金属中心,我想问一下这个2连接的节点是否应该保留?据我所知只有三连接以上的才算节点,如果不保留的话该怎样操作,将该节点的折线变成连接两个金属的直线?两个金属之间的距离在9A多


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  • 黎明之前失眠
    沙发
    黎明之前失眠 (楼主) 2025-05-01 13:24:33 发布自吉林
    已经找到解决方法了,选中分子式,点菜单栏中的Compound→Auto determine→Simplity Adjacency Matrix,或者直接Ctrl+S快捷键跳出弹窗,勾选remove栏中的前三个即:0-coordinated、1-coordinated、2-coordianted,type栏中第一个Valence,点ok即可
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