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Topospro软件中如何处理2连接的“节点”？

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黎明之前失眠
黎明之前失眠 来自吉林， 发表于：2025-05-01 09:56:31

在topospro软件中画拓扑结构，有的配体由于弯曲的构型形成了一个2连接的节点连接两个金属中心，我想问一下这个2连接的节点是否应该保留？据我所知只有三连接以上的才算节点，如果不保留的话该怎样操作，将该节点的折线变成连接两个金属的直线？两个金属之间的距离在9A多

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回帖
  • 黎明之前失眠
    沙发
    黎明之前失眠 (楼主) 2025-05-01 13:24:33 发布自吉林，
    已经找到解决方法了，选中分子式，点菜单栏中的Compound→Auto determine→Simplity Adjacency Matrix，或者直接Ctrl＋S快捷键跳出弹窗，勾选remove栏中的前三个即：0-coordinated、1-coordinated、2-coordianted，type栏中第一个Valence，点ok即可
    回复
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