Transcriptomic analyses of genes and tissues in inherited sensory neuropathies

转录组 生物 基因 感觉系统 雪旺细胞 神经科学 感觉神经元 基因表达 细胞生物学 遗传学
作者
Matthew R. Sapio,Samridhi C. Goswami,Jacklyn R. Gross,Andrew J. Mannes,Michael J. Iadarola
出处
期刊:Experimental Neurology [Elsevier BV]
卷期号:283: 375-395 被引量:47
标识
DOI:10.1016/j.expneurol.2016.06.023
摘要

Inherited sensory neuropathies are caused by mutations in genes affecting either primary afferent neurons, or the Schwann cells that myelinate them. Using RNA-Seq, we analyzed the transcriptome of human and rat DRG and peripheral nerve, which contain sensory neurons and Schwann cells, respectively. We subdivide inherited sensory neuropathies based on expression of the mutated gene in these tissues, as well as in mouse TRPV1 lineage DRG nociceptive neurons, and across 32 human tissues from the Human Protein Atlas. We propose that this comprehensive approach to neuropathy gene expression leads to better understanding of the involved cell types in patients with these disorders. We also characterize the genetic "fingerprint" of both tissues, and present the highly tissue-specific genes in DRG and sciatic nerve that may aid in the development of gene panels to improve diagnostics for genetic neuropathies, and may represent specific drug targets for diseases of these tissues.

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