Pan‐cancer analysis of iron metabolic landscape across the Cancer Genome Atlas

基因 DNA甲基化 表观遗传学 生物 异位表达 癌症 图谱 癌症研究 基因表达谱 癌细胞 肾癌 生物信息学 肾细胞癌 基因组 计算生物学 基因表达 遗传学 医学 肿瘤科 蛋白质表达
作者
Su Zhang,Wei Chang,Hao Wu,Yu Han Wang,Yu Gong,You Li Zhao,Shan Hui Liu,Han Zhang Wang,Robert S. Svatek,Ronald Rodríguez,Zhi Ping Wang
出处
期刊:Journal of Cellular Physiology [Wiley]
卷期号:235 (2): 1013-1024 被引量:43
标识
DOI:10.1002/jcp.29017
摘要

Iron is an essential metal ion in the human body and usually dysregulated in cancers. However, a comprehensive overview of the iron-related genes and their clinical relevance in cancer is lacking. In this study, we utilized the expression profiling, proteomics, and epigenetics from the Cancer Genome Atlas database to systematically characterized the alterations of iron-related genes. There were multiple iron-related genes with dysregulation across 14 cancers and some of these ectopic changes may be associated with aberrant DNA methylation. Meanwhile, a variety of genes were significantly associated with patient survival, especially in kidney renal clear cell carcinoma. Then differentially expressed genes were validated in clinical samples. Finally, we found deferoxamine and erastin could inhibit proliferation in various tumor cells and influence the expression of several iron-related genes. Overall, our study provides a comprehensive analysis of iron metabolism across cancers and highlights the potential treatment of iron targeted therapies for cancers.

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