Modular Pathway Rewiring of Yeast for Amino Acid Production

氨基酸 模块化设计 酵母 生物化学 生产(经济) 生物 化学 计算生物学 计算机科学 程序设计语言 经济 宏观经济学
作者
Quanli Liu,Tao Yu,Kate Campbell,Jens Nielsen,Yun Chen
出处
期刊:Methods in Enzymology [Academic Press]
卷期号:608: 417-439 被引量:13
标识
DOI:10.1016/bs.mie.2018.06.009
摘要

Amino acids find various applications in biotechnology in view of their importance in the food, feed, pharmaceutical, and personal care industries as nutrients, additives, and drugs, respectively. For the large-scale production of amino acids, microbial cell factories are widely used and the development of amino acid-producing strains has mainly focused on prokaryotes Corynebacterium glutamicum and Escherichia coli. However, the eukaryote Saccharomyces cerevisiae is becoming an even more appealing microbial host for production of amino acids and derivatives because of its superior molecular and physiological features, such as amenable to genetic engineering and high tolerance to harsh conditions. To transform S. cerevisiae into an industrial amino acid production platform, the highly coordinated and multiple layers regulation in its amino acid metabolism should be relieved and reconstituted to optimize the metabolic flux toward synthesis of target products. This chapter describes principles, strategies, and applications of modular pathway rewiring in yeast using the engineering of l-ornithine metabolism as a paradigm. Additionally, detailed protocols for in vitro module construction and CRISPR/Cas-mediated pathway assembly are provided.
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