A compendium of mutational cancer driver genes

简编 癌变 基因 癌症 生物 体细胞 突变 计算生物学 生物信息学 遗传学 鉴定(生物学) 植物 历史 考古
作者
Francisco Martínez-Jiménez,Ferran Muiños,Inés Sentís,Jordi Deu-Pons,Iker Reyes-Salazar,Claudia Arnedo-Pac,Loris Mularoni,Oriol Pich,Jose Bonet,Hanna Kranas,Abel González-Pérez,Núria López‐Bigas
出处
期刊:Nature Reviews Cancer [Springer Nature]
卷期号:20 (10): 555-572 被引量:623
标识
DOI:10.1038/s41568-020-0290-x
摘要

A fundamental goal in cancer research is to understand the mechanisms of cell transformation. This is key to developing more efficient cancer detection methods and therapeutic approaches. One milestone towards this objective is the identification of all the genes with mutations capable of driving tumours. Since the 1970s, the list of cancer genes has been growing steadily. Because cancer driver genes are under positive selection in tumorigenesis, their observed patterns of somatic mutations across tumours in a cohort deviate from those expected from neutral mutagenesis. These deviations, which constitute signals of positive selection, may be detected by carefully designed bioinformatics methods, which have become the state of the art in the identification of driver genes. A systematic approach combining several of these signals could lead to a compendium of mutational cancer genes. In this Review, we present the Integrative OncoGenomics (IntOGen) pipeline, an implementation of such an approach to obtain the compendium of mutational cancer drivers. Its application to somatic mutations of more than 28,000 tumours of 66 cancer types reveals 568 cancer genes and points towards their mechanisms of tumorigenesis. The application of this approach to the ever-growing datasets of somatic tumour mutations will support the continuous refinement of our knowledge of the genetic basis of cancer. This Review provides a brief historical perspective of our understanding of the role of cancer genes before presenting the Integrative OncoGenomics (IntOGen) platform, a bioinformatics method of mutational driver identification, which is beginning to reveal the compendium of driver genes across many tumour types as well as alluding to their tumorigenic mechanisms.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
做自己完成签到 ,获得积分10
2秒前
看火人完成签到 ,获得积分10
5秒前
俭朴的世界完成签到 ,获得积分10
12秒前
啦啦啦魔法大师完成签到,获得积分10
13秒前
笨笨熊完成签到 ,获得积分10
18秒前
兴奋的觅露完成签到,获得积分10
20秒前
Joany完成签到,获得积分10
24秒前
25秒前
zqx完成签到 ,获得积分10
29秒前
知林的喵完成签到 ,获得积分10
33秒前
39秒前
vassallo完成签到 ,获得积分10
41秒前
bing完成签到 ,获得积分10
56秒前
Ding完成签到,获得积分10
59秒前
汉堡完成签到 ,获得积分10
1分钟前
早日毕业应助long采纳,获得30
1分钟前
Deila完成签到 ,获得积分10
1分钟前
胜胜糖完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
jjj完成签到 ,获得积分10
1分钟前
平常山河完成签到 ,获得积分10
1分钟前
经青寒完成签到 ,获得积分10
1分钟前
求其发布了新的文献求助10
1分钟前
long完成签到,获得积分10
1分钟前
哭泣的映寒完成签到 ,获得积分10
1分钟前
真命天子完成签到 ,获得积分10
1分钟前
PeterBeau完成签到 ,获得积分10
1分钟前
向日葵完成签到 ,获得积分10
1分钟前
内向忆南完成签到,获得积分10
1分钟前
笨蛋琪露诺完成签到,获得积分10
1分钟前
JAMA兜里揣完成签到 ,获得积分10
1分钟前
内向忆南发布了新的文献求助20
1分钟前
CR完成签到 ,获得积分10
2分钟前
2分钟前
Y_发布了新的文献求助10
2分钟前
乔杰完成签到 ,获得积分10
2分钟前
南风不竞完成签到,获得积分10
2分钟前
哎嘿菜菜完成签到 ,获得积分10
2分钟前
lj完成签到 ,获得积分10
2分钟前
张小度ever完成签到 ,获得积分10
2分钟前
高分求助中
Manual of Clinical Microbiology, 4 Volume Set (ASM Books) 13th Edition 1000
Cross-Cultural Psychology: Critical Thinking and Contemporary Applications (8th edition) 800
Counseling With Immigrants, Refugees, and Their Families From Social Justice Perspectives pages 800
マンネンタケ科植物由来メロテルペノイド類の網羅的全合成/Collective Synthesis of Meroterpenoids Derived from Ganoderma Family 500
岩石破裂过程的数值模拟研究 500
Electrochemistry 500
[Lambert-Eaton syndrome without calcium channel autoantibodies] 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 有机化学 工程类 生物化学 纳米技术 物理 内科学 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 电极 光电子学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 2374170
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2081547
关于积分的说明 5216397
捐赠科研通 1809167
什么是DOI,文献DOI怎么找? 902933
版权声明 558406
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 482109