Rev1 Employs a Novel Mechanism of DNA Synthesis Using a Protein Template

DNA 机制(生物学) 计算生物学 DNA合成 模板 化学 组合化学 计算机科学 生物 生物化学 程序设计语言 物理 量子力学
作者
D.T. Nair,Robert E. Johnson,Louise Prakash,Satya Prakash,Aneel K. Aggarwal
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science]
卷期号:309 (5744): 2219-2222 被引量:240
标识
DOI:10.1126/science.1116336
摘要

The Rev1 DNA polymerase is highly specialized for the incorporation of C opposite template G. We present here the crystal structure of yeast Rev1 bound to template G and incoming 2′-deoxycytidine 5′-triphosphate (dCTP), which reveals that the polymerase itself dictates the identity of the incoming nucleotide, as well as the identity of the templating base. Template G and incoming dCTP do not pair with each other. Instead, the template G is evicted from the DNA helix, and it makes optimal hydrogen bonds with a segment of Rev1. Also, unlike other DNA polymerases, incoming dCTP pairs with an arginine rather than the templating base, which ensures the incorporation of dCTP over other incoming nucleotides. This mechanism provides an elegant means for promoting proficient and error-free synthesis through N 2 -adducted guanines that obstruct replication.
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