Specific suppression of D-RNA G-quadruplex–protein interaction with an L-RNA aptamer

适体 G-四倍体 生物 核糖核酸 核仁素 核酸 核酸结构 DNA 指数富集配体系统进化 遗传学 RNA结合蛋白 非编码RNA 计算生物学 分子生物学 生物化学 基因 细胞质 核仁
作者
Mubarak Ishaq Umar,Chun Kit Kwok
出处
期刊:Nucleic Acids Research [Oxford University Press]
卷期号:48 (18): 10125-10141 被引量:26
标识
DOI:10.1093/nar/gkaa759
摘要

Abstract G-quadruplexes (G4s) are nucleic acid structure motifs that are of significance in chemistry and biology. The function of G4s is often governed by their interaction with G4-binding proteins. Few categories of G4-specific tools have been developed to inhibit G4–protein interactions; however, until now there is no aptamer tool being developed to do so. Herein, we present a novel L-RNA aptamer that can generally bind to D-RNA G-quadruplex (rG4) structure, and interfere with rG4–protein interaction. Using hTERC rG4 as the target for in vitro selection, we report the shortest L-aptamer being developed so far, with only 25 nucleotides. Notably, this new aptamer, L-Apt.4-1c, adopts a stem–loop structure with the loop folding into an rG4 motif with two G-quartet, demonstrates preferential binding toward rG4s over non-G4s and DNA G-quadruplexes (dG4s), and suppresses hTERC rG4–nucleolin interactions. We also show that inhibition of rG4–protein interaction using L-RNA aptamer L-Apt.4-1c is comparable to or better than G4-specific ligands such as carboxypyridostatin and QUMA-1 respectively, highlighting that our approach and findings expand the current G4 toolbox, and open a new avenue for diverse applications.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
wang5945发布了新的文献求助10
刚刚
猪猪hero发布了新的文献求助10
1秒前
fanmo完成签到 ,获得积分0
1秒前
木子成发布了新的文献求助20
1秒前
1秒前
ling2001完成签到,获得积分10
2秒前
Melanie发布了新的文献求助30
2秒前
3秒前
3秒前
任性亦竹完成签到,获得积分10
4秒前
elous发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
Steplan完成签到,获得积分10
6秒前
猪猪hero发布了新的文献求助10
8秒前
孙pc完成签到,获得积分10
9秒前
忍蛙完成签到,获得积分10
9秒前
痴情的代荷发布了新的文献求助100
9秒前
雪雪完成签到 ,获得积分10
9秒前
不缺人YYDS发布了新的文献求助10
9秒前
10秒前
12秒前
豆豆完成签到,获得积分20
12秒前
iu发布了新的文献求助10
13秒前
善学以致用应助夹子方糖采纳,获得10
14秒前
14秒前
3477完成签到,获得积分10
15秒前
多宝鱼发布了新的文献求助10
16秒前
16秒前
18秒前
Lucas应助猪猪hero采纳,获得10
18秒前
大壮发布了新的文献求助10
18秒前
啊啊发布了新的文献求助10
18秒前
小九202301完成签到,获得积分10
18秒前
21秒前
21秒前
3477发布了新的文献求助10
21秒前
东方桃子完成签到,获得积分10
23秒前
言言发布了新的文献求助10
24秒前
Honor发布了新的文献求助10
25秒前
xmfffff完成签到,获得积分10
26秒前
高分求助中
Les Mantodea de Guyane Insecta, Polyneoptera 2500
One Man Talking: Selected Essays of Shao Xunmei, 1929–1939 (PDF!) 1000
Technologies supporting mass customization of apparel: A pilot project 450
A Field Guide to the Amphibians and Reptiles of Madagascar - Frank Glaw and Miguel Vences - 3rd Edition 400
China Gadabouts: New Frontiers of Humanitarian Nursing, 1941–51 400
The Healthy Socialist Life in Maoist China, 1949–1980 400
Walking a Tightrope: Memories of Wu Jieping, Personal Physician to China's Leaders 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 计算机科学 化学工程 内科学 复合材料 物理化学 电极 遗传学 量子力学 基因 冶金 催化作用
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3787674
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3333279
关于积分的说明 10260839
捐赠科研通 3048919
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1673344
邀请新用户注册赠送积分活动 801792
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 760344