An Automated Multi-Sample Digital LAMP Platform for Quantitative Detection of SDC2 Methylation in Colorectal Cancer

甲基化 DNA甲基化 结直肠癌 生物标志物 吞吐量 化学 数字聚合酶链反应 环介导等温扩增 计算生物学 癌症 熔化曲线分析 癌症研究 样品(材料) 癌症生物标志物 转录组 DNA微阵列 微流控 微阵列 炸薯条 微流控芯片 亚硫酸氢盐测序 DNA
作者
Hao He,Yanzhao Wu,Lai Wei,Lin Zhou,Zhirui Liu,Nan Rong,Chunxiong Luo,Chanqiong Zhang,Wei Yang
出处
期刊:Analytical Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:97 (39): 21438-21448 被引量:1
标识
DOI:10.1021/acs.analchem.5c03244
摘要

DNA methylation of the SDC2 gene has emerged as a critical biomarker for early detection of colorectal cancer (CRC). However, effective clinical application demands analytical platforms that offer enhanced accuracy, speed, and sample high-throughput capacity. In this study, we present an automated multisample digital loop-mediated isothermal amplification (dLAMP) platform designed to meet these requirements. Our platform integrates a dual-volume microfluidic chip capable of analyzing 4 or 8 samples in parallel, significantly enhancing sample throughput and efficiency. Integrated with automatic sample injection and advanced image processing, the platform achieves streamlined, multistep analysis of SDC2 methylation levels. We designed methylation-specific (MS) and unmethylation-specific (UMS) LAMP primers with high specificity. Validation using CRC cell lines (HCT116 and Caco-2) and clinical tissue samples demonstrated robust performance with high sensitivity, specificity and reproducibility. The results showed elevated SDC2 methylation was detected in tumor tissues across all CRC stages. This integrated automated dLAMP platform provides a robust, multisample high-throughput tool for methylation-based diagnostics and holds strong potential for noninvasive early cancer screening and clinical biomarker applications.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
cdercder应助mwwbhu采纳,获得10
刚刚
2秒前
优美的冰巧完成签到 ,获得积分10
2秒前
咕咕发布了新的文献求助10
2秒前
顾矜应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
4秒前
田様应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
Orange应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
昏睡的帆布鞋完成签到 ,获得积分10
4秒前
瓦片制度发布了新的文献求助10
4秒前
大模型应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
共享精神应助科研通管家采纳,获得200
4秒前
wanci应助科研通管家采纳,获得20
4秒前
传奇3应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
4秒前
田様应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
可可应助科研通管家采纳,获得20
5秒前
科目三应助科研通管家采纳,获得10
5秒前
研友_VZG7GZ应助科研通管家采纳,获得10
5秒前
5秒前
高越完成签到,获得积分10
6秒前
yyds完成签到,获得积分10
6秒前
黎长江完成签到,获得积分10
6秒前
李健的小迷弟应助Owen采纳,获得10
6秒前
米斯特刘完成签到,获得积分10
6秒前
米小宇关注了科研通微信公众号
8秒前
369ninja应助wang采纳,获得10
8秒前
lhy发布了新的文献求助10
9秒前
复杂的从彤完成签到,获得积分10
9秒前
Feiyan完成签到,获得积分10
9秒前
丹布里发布了新的文献求助10
10秒前
曲绫完成签到 ,获得积分10
10秒前
留胡子的黑夜完成签到,获得积分10
12秒前
hmyh1202完成签到,获得积分10
12秒前
12秒前
whale发布了新的文献求助10
14秒前
科研通AI6.4应助山谷采纳,获得10
14秒前
15秒前
CodeCraft应助xwwdcg采纳,获得10
15秒前
高分求助中
Cronologia da história de Macau 5000
Erwählung und Berufung bei Paulus: Bedeutung, Entwicklung und Funktion einer Vorstellung in ihrem frühjüdischen und griechisch-römischen Kontext 850
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition 510
Interactions of Vowel Quality and Prosody in East Slavic 500
Vander's Renal Physiology第10版 500
Animalia: Animal and Human Interaction in the Early Medieval English World (Exeter Studies in Medieval Europe) 400
Synfacts Issue 07 · Volume 22 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7131733
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8781620
关于积分的说明 18564112
捐赠科研通 6714962
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3152308
关于科研通互助平台的介绍 2276559
邀请新用户注册赠送积分活动 2126682