Multimodal fusion of radio-pathology and proteogenomics identify integrated glioma subtypes with prognostic and therapeutic opportunities

蛋白质基因组学 胶质瘤 医学 计算生物学 病理 生物信息学 生物 癌症研究 基因组学 基因组 遗传学 基因
作者
Zaoqu Liu,Yushuai Wu,Hui Xu,Minkai Wang,Siyuan Weng,Dongling Pei,Shuang Chen,Weiwei Wang,Jing Yan,Li Cui,Jingxian Duan,Yuanshen Zhao,Zilong Wang,Zeyu Ma,Ran Li,Wenchao Duan,Yuning Qiu,Dingyuan Su,Sen Li,Haoran Liu
出处
期刊:Nature Communications [Nature Portfolio]
卷期号:16 (1)
标识
DOI:10.1038/s41467-025-58675-9
摘要

Integrating multimodal data can uncover causal features hidden in single-modality analyses, offering a comprehensive understanding of disease complexity. This study introduces a multimodal fusion subtyping (MOFS) framework that integrates radiological, pathological, genomic, transcriptomic, and proteomic data from 122 patients with IDH-wildtype adult glioma, identifying three subtypes: MOFS1 (proneural) with favorable prognosis, elevated neurodevelopmental activity, and abundant neurocyte infiltration; MOFS2 (proliferative) with the worst prognosis, superior proliferative activity, and genome instability; MOFS3 (TME-rich) with intermediate prognosis, abundant immune and stromal components, and sensitive to anti-PD-1 immunotherapy. STRAP emerges as a prognostic biomarker and potential therapeutic target for MOFS2, associated with its proliferative phenotype. Stromal infiltration in MOFS3 serves as a crucial prognostic indicator, allowing for further prognostic stratification. Additionally, we develop a deep neural network (DNN) classifier based on radiological features to further enhance the clinical translatability, providing a non-invasive tool for predicting MOFS subtypes. Overall, these findings highlight the potential of multimodal fusion in improving the classification, prognostic accuracy, and precision therapy of IDH-wildtype glioma, offering an avenue for personalized management.
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