Comparative mitogenomic analysis of two earwigs (Insecta, Dermaptera) and the preliminary phylogenetic implications

生物 系统发育树 转移RNA 基因 核糖体RNA 进化生物学 遗传学 系统发育学 线粒体DNA 核糖核酸
作者
Zhi-Teng Chen
出处
期刊:ZooKeys [Pensoft Publishers]
卷期号:1087: 105-122 被引量:2
标识
DOI:10.3897/zookeys.1087.78998
摘要

The phylogenetic position and inner relationships of Dermaptera remain unresolved despite the numerous efforts using morphological and molecular data. To facilitate the resolution of problems, this study sequenced the complete mitogenome of Apachyusfeae de Bormans, 1894 (Apachyidae) and the nearly complete mitogenome of Diplatysflavicollis Shiraki, 1907 (Diplatyidae). The 19,029-bp long mitogenome of A.feae exhibited an extra trnV gene and two control regions in addition to the typical set of 37 genes including 13 protein-coding genes (PCGs), 22 transfer RNA (tRNA) genes, and two ribosomal RNA (rRNA) genes. The 12,950-bp long partially sequenced mitogenome of D.flavicollis was composed of 10 and a partial fragment of PCGs, 18 tRNA genes, two rRNA genes, and a control region. Comparative analysis of available earwig mitogenomes revealed variable mitogenomic structure and extensive gene rearrangements in Dermaptera. The preliminary phylogenetic analyses using Bayesian inference and maximum likelihood methods showed identical results, but the limited sampling and different types of molecular data lead to an apparent incongruence with previous phylogenetic studies.

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