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The cofactors and domains of a staphylococcal capsule-producing enzyme preserve its structure, stability, shape and dimerization ability

辅因子 化学 重组DNA 生物化学 蛋白质结构 生物物理学 立体化学 生物 基因
作者
Tushar Chakraborty,Nilanjan Banerjee,Debasmita Sinha,Soham Seal,Subhrangsu Chatterjee,Subrata Sau
出处
期刊:Journal of Biochemistry [Oxford University Press]
卷期号:173 (6): 471-486 被引量:1
标识
DOI:10.1093/jb/mvad014
摘要

CapF, a staphylococcal capsule-producing enzyme, binds Zn2+ ion and NADPH using its C-terminal domain (CTD) and N-terminal domain (NTD), respectively. To elucidate the roles of cofactors and domains, we have systematically investigated the related recombinant proteins, rCapF, rCTD, recombinant NTD (rNTD) and the Zn2+-free rCapF/rCTD, Apo-rCapF/Apo-rCTD. The results show that the secondary structure, tertiary structure, shape and surface hydrophobicity of Apo-rCapF and Apo-rCTD are different from those of rCapF and rCTD. The removal of Zn2+ made rCapF thermo-sensitive, whereas both rCTD and Apo-rCTD are thermo-resistant proteins. Further, Apo-rCapF and rCapF existed as the dimers, whereas rCTD and Apo-rCTD formed a mixture of dimers and tetramers in the aqueous solution. Zn2+ maintained the structure of NTD as well. The NADPH binding activity and Cys accessibility of rNTD, rCapF and Apo-rCapF were significantly different from each other. The binding of NADPH to the above three proteins freely occurred, liberated heat at 25°C and increased their diameters. In addition, the structure, stability, shape and oligomerization ability of rNTD, rCTD and rCapF little resembled each other. Collectively, the domains and cofactors of CapF contribute to preserving its conformation, stability, shape and dimerization ability.

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