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Acid···Amide Supramolecular Synthon in Cocrystals: From Spectroscopic Detection to Property Engineering

合成子 化学 超分子化学 晶体工程 酰胺 氢键 二聚体 结晶学 立体化学 脱质子化 结晶 晶体结构 分子 有机化学 离子
作者
Subhankar Saha,Gautam R. Desiraju
出处
期刊:Journal of the American Chemical Society [American Chemical Society]
卷期号:140 (20): 6361-6373 被引量:128
标识
DOI:10.1021/jacs.8b02435
摘要

The acid···amide dimer heterosynthon in cocrystals of aromatic acids and primary amides is identified by marker peaks in the IR spectra that are characteristic of individual N-H···O and O-H···O interactions and also of the extended synthon. The O-H···O hydrogen bond is crucial to heterodimer formation in contrast to the N-H···O bond. A combinatorial study, tuning the chemical nature of acid and amide functionalities, leads to 22 cocrystals out of 36 crystallization attempts. Four quadrants I-IV are defined based on acidity and basicity of the acid and amide components. The strong acid-strong base combination in quadrant I favors the planar acid···amide heterodimer in its eight cocrystals. Quadrant IV with its weak acid-weak base combination is the least favored for the planar heterosynthon and synthon diversity is observed in the eight cocrystals obtained. The strong-weak and weak-strong combinations in quadrants II and III are expectedly ambivalent. This exercise highlights the effect of molecular features on supramolecular behavior. Quadrant I crystals, with their propensity for the planar acid···amide heterodimer are suitable for the engineering of crystals that can be sheared. This quadrant favors the formation of elastic crystals too. The overall result is that 57% (4 in 7) of all crystals in this quadrant are deformable, compared with 14% (1 in 7) in the three other quadrants. This work is a complete crystal engineering exercise from synthon identification to a particular desired crystal packing to property selection. One can virtually anticipate the mechanical property of a putative acid···amide cocrystal from a knowledge of just the molecular structures of the constituent acid and amide molecules.
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