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Control of encounter kinetics by chemically active droplets

化学物理 动力学 非平衡态热力学 化学 布朗运动 化学动力学 分子动力学 化学反应 扩散 联轴节(管道) 相(物质) 纳米反应器 猝灭(荧光) 介观物理学 布朗动力学 生物物理学 自催化 纳米技术 活性物质 化学稳定性 化学能 分子扩散 生物系统 超临界流体 分子 同种类的 亚稳态 动力学(音乐) 化学过程
作者
Jacques Fries,Roxanne Berthin,Marie Jardat,Pierre Illien,Vincent Dahirel
出处
期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [National Academy of Sciences]
卷期号:122 (49): e2511670122-e2511670122
标识
DOI:10.1073/pnas.2511670122
摘要

Biomolecular condensates play a crucial role in the spatial organization of living matter. These membrane-less organelles, resulting from liquid-liquid phase separation, operate far from thermodynamic equilibrium, with their size and stability influenced by nonequilibrium chemical reactions. While condensates are frequently considered optimized nanoreactors that enhance molecular encounters, their actual impact on reaction kinetics remains unclear due to competing effects such as diffusion hindrance, and random trapping in nonspecific condensates. In this study, we develop a microscopic, stochastic model for chemically active droplets, incorporating reaction-driven modulation of protein interactions. Using Brownian dynamics simulations, we investigate how protein interactions and active coupling to a free energy reservoir influence phase separation, molecular transport, and reaction kinetics. We demonstrate that the intensity of the chemical drive governs surface dynamics, generating fluxes that modulate bimolecular reaction rates. Comparing active emulsions to homogeneous systems, we reveal that condensates can either accelerate or decelerate molecular encounters. Our findings provide key insights into the role of biomolecular condensates as potential regulators of intracellular reaction kinetics.
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