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Loop-Mediated Isothermal Amplification: From Theory to Practice

环介导等温扩增 放大器 等温过程 核酸 计算生物学 底漆(化妆品) 分子诊断学 聚合酶链反应 纳米技术 生物 DNA 材料科学 物理 生物信息学 遗传学 基因 热力学
作者
Fedor V. Shirshikov,Julia Bespyatykh
出处
期刊:Russian Journal of Bioorganic Chemistry [Pleiades Publishing]
卷期号:48 (6): 1159-1174 被引量:24
标识
DOI:10.1134/s106816202206022x
摘要

Increasing the accuracy of pathogen identification and reducing the duration of analysis remain relevant for modern molecular diagnostics up to this day. In laboratory and clinical practice, detection of pathogens mostly relies on methods of nucleic acid amplification, among which the polymerase chain reaction (PCR) is considered the "gold standard." Nevertheless, in some cases, isothermal amplification methods act as an alternative to PCR diagnostics. Upon more than thirty years of the development of isothermal DNA synthesis, the appearance of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) has enabled new directions of in-field diagnostics of bacterial and viral infections. This review examines the key characteristics of the LAMP method and corresponding features in practice. We discuss the structure of LAMP amplicons with single-stranded loops, which have the sites for primer annealing under isothermal conditions. The latest achievements in the modification of the LAMP method are analyzed, which allow considering it as a unique platform for creating the next-generation diagnostic assays.
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