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Exploring the Trans‐Cleavage Activity of CRISPR‐Cas12a (cpf1) for the Development of a Universal Electrochemical Biosensor

清脆的 生物传感器 计算生物学 化学 纳米技术 劈理(地质) 组合化学 计算机科学 生物 材料科学 生物化学 基因 断裂(地质) 古生物学
作者
Yifan Dai,Rodrigo A. Somoza,Liu Wang,Jean F. Welter,Yan Li,Arnold I. Caplan,Chung Chiun Liu
出处
期刊:Angewandte Chemie [Wiley]
卷期号:58 (48): 17399-17405 被引量:399
标识
DOI:10.1002/anie.201910772
摘要

Abstract An accurate, rapid, and cost‐effective biosensor for the quantification of disease biomarkers is vital for the development of early‐diagnostic point‐of‐care systems. The recent discovery of the trans‐cleavage property of CRISPR type V effectors makes CRISPR a potential high‐accuracy bio‐recognition tool. Herein, a CRISPR‐Cas12a (cpf1) based electrochemical biosensor (E‐CRISPR) is reported, which is more cost‐effective and portable than optical‐transduction‐based biosensors. Through optimizing the in vitro trans‐cleavage activity of Cas12a, E‐CRIPSR was used to detect viral nucleic acids, including human papillomavirus 16 (HPV‐16) and parvovirus B19 (PB‐19), with a picomolar sensitivity. An aptamer‐based E‐CRISPR cascade was further designed for the detection of transforming growth factor β1 (TGF‐β1) protein in clinical samples. As demonstrated, E‐CRISPR could enable the development of portable, accurate, and cost‐effective point‐of‐care diagnostic systems.
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