G-quadruplex dynamics

核酸 鸟苷 功能(生物学) G-四倍体 计算生物学 生物物理学 动力学(音乐) 分子动力学 化学 核糖核酸 DNA 纳米技术 生物 物理 基因 细胞生物学 生物化学 计算化学 声学 材料科学
作者
Robert W. Harkness,Anthony Mittermaier
出处
期刊:Biochimica Et Biophysica Acta - Proteins And Proteomics [Elsevier BV]
卷期号:1865 (11): 1544-1554 被引量:51
标识
DOI:10.1016/j.bbapap.2017.06.012
摘要

G-quadruplexes (GQs) are four-stranded nucleic acid secondary structures formed by guanosine (G)-rich DNA and RNA sequences. It is becoming increasingly clear that cellular processes including gene expression and mRNA translation are regulated by GQs. GQ structures have been extensively characterized, however little attention to date has been paid to their conformational dynamics, despite the fact that many biological GQ sequences populate multiple structures of similar free energies, leading to an ensemble of exchanging conformations. The impact of these dynamics on biological function is currently not well understood. Recently, structural dynamics have been demonstrated to entropically stabilize GQ ensembles, potentially modulating gene expression. Transient, low-populated states in GQ ensembles may additionally regulate nucleic acid interactions and function. This review will underscore the interplay of GQ dynamics and biological function, focusing on several dynamic processes for biological GQs and the characterization of GQ dynamics by nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy in conjunction with other biophysical techniques. This article is part of a Special Issue entitled: Biophysics in Canada, edited by Lewis Kay, John Baenziger, Albert Berghuis and Peter Tieleman.

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