Discovery of a novel thermostable Zn2+ -dependent alcohol dehydrogenase from Chloroflexus aurantiacus through conserved domains mining

硫矿硫化叶菌 嗜热菌 超嗜热菌 生物 磺基 醇脱氢酶 生物催化 古细菌 大肠杆菌 计算生物学 生物化学 功能(生物学) 基因 基质(水族馆) 蛋白质工程 遗传学 生态学 催化作用 离子液体
作者
Christoph Loderer,David Wagner,F. Morgenstern,Antje C. Spieß,Marion B. Ansorge‐Schumacher
出处
期刊:Journal of Applied Microbiology [Oxford University Press]
卷期号:124 (2): 480-490 被引量:4
标识
DOI:10.1111/jam.13664
摘要

The purpose of the study was to demonstrate feasibility of the Conserved Domains Database (CDD) for identification of novel biocatalysts with desirable properties from a class of well‐characterized biocatalysts. The thermostable ADH from Sulfolobus solfataricus with a broad substrate range was applied as a template for the search for novel thermostable ADHs via CDD. From the resulting hits, a putative ADH gene from the thermophilic organism Chloroflexus aurantiacus was cloned and expressed in Escherichia coli. The resulting enzyme was purified and characterized. With a temperature activity optimum of 70°C and a broad substrate spectrum especially for diketones, a versatile new biocatalyst was obtained. Database‐based mining in CDD is a suitable approach to obtain novel biocatalysts with desirable properties. Thereby, the available diversity of similar but not equal enzymes within this class can be increased. For industrial applications, there is a demand for larger diversity of similar well‐characterized enzymes in order to test them for a given process (biodiversity screening). For fundamental science, the comparison of enzymes with similar function but different sequence can provide insight into structure function relationships or the evolution of enzymes. This study gives a good example on how this demand can be efficiently met.

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