De novo Drug Design using Reinforcement Learning with Multiple GPT Agents

强化学习 计算机科学 水准点(测量) 药品 药物发现 计算生物学 机器学习 生物 生物信息学 药理学 大地测量学 地理
作者
Xiuyuan Hu,Guoqing Liu,Yang Zhao,Hao Zhang
出处
期刊:Cornell University - arXiv [Cornell University]
被引量:4
标识
DOI:10.48550/arxiv.2401.06155
摘要

De novo drug design is a pivotal issue in pharmacology and a new area of focus in AI for science research. A central challenge in this field is to generate molecules with specific properties while also producing a wide range of diverse candidates. Although advanced technologies such as transformer models and reinforcement learning have been applied in drug design, their potential has not been fully realized. Therefore, we propose MolRL-MGPT, a reinforcement learning algorithm with multiple GPT agents for drug molecular generation. To promote molecular diversity, we encourage the agents to collaborate in searching for desirable molecules in diverse directions. Our algorithm has shown promising results on the GuacaMol benchmark and exhibits efficacy in designing inhibitors against SARS-CoV-2 protein targets. The codes are available at: https://github.com/HXYfighter/MolRL-MGPT.
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