Single Cell Proteomics Reveals Novel Cell Phenotypes in Marfan Mouse Aneurysm

马凡氏综合征 表型 蛋白质组学 细胞 生物 计算生物学 细胞生物学 医学 遗传学 内科学 基因
作者
Louis Saddic,Giselle Kaneda,Amanda Momenzadeh,Lior Zilberberg,Yang Song,Mitra Mastali,Simion Kreimer,A. Hutton,Ali Haghani,Jesse G. Meyer,Sarah J. Parker
出处
期刊: [Cold Spring Harbor Laboratory]
被引量:2
标识
DOI:10.1101/2025.02.15.638465
摘要

Next generation sequencing (NGS), Mass spectrometer (MS), Single cell proteomics by Mass Spectrometry (ScOPE-MS), Marfan's syndrome (MFS), Fibrillin 1 (FBN1), Transforming growth factor β (TGFβ), Smooth muscle cell (SMC), Single cell proteomic (scProteomic), Differentially expressed proteins (DEPs), Wild-type (WT), Hanks' balanced salt solution (HBSS), Fetal bovine serum (FBS), Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM), Data-independent acquisition parallel accumulation-serial fragmentation (DIA-PASEF), Magnetic assisted cell sorted (MACS), Single Cell Analysis in Python (Scanpy), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), Principal component analysis (PCA), Uniform manifold projection (UMAP), Single cell transcriptomic (scTranscriptomic), Smoothelin (Smtn), Transgelin (Tagln), Myosin heavy chain 11 (Myh11), Platelet endothelial cell adhesion molecule 1 (Pecam1), Dipeptidase 1 (Dpep1), Uncoupling protein 1 (Ucp1), Low-density lipoprotein receptor-related protein (Lrp1), DNA ligase 3 (Lig3), Capsaicin channel transient receptor potential vanilloid 1 (Trpv1), Endothelial to mesenchymal transition (endMT), Intercellular adhesion molecule 1 (Icam1), Intercellular adhesion molecule 2 (Icam2), Endothelial cell-selective adhesion molecule (Esam), Calponin 1 (Cnn1), Vimentin (Vim), Zinc finger E-box-binding homeobox 1 (Zeb1), Snail family transcriptional repressor 1 (Snai1), Tropomyosin alpha-4 chain (Tpm4), Angiotensin converting enzyme (Ace).
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