Identification of Burkholderia cepacia complex by PCR: A simple way

伯克氏菌属 洋葱伯克霍尔德菌复合体 鉴定(生物学) 微生物学 分离(微生物学) 琼脂 聚合酶链反应 计算生物学 生物 细菌 遗传学 植物 基因
作者
Geneviève Dufour,Karine Lebel,Julie Bellemare,Irène Iugovaz
出处
期刊:Pda Journal of Pharmaceutical Science and Technology [Parenteral Drug Association]
卷期号:77 (6): 485-497
标识
DOI:10.5731/pdajpst.2021.012720
摘要

USP General Chapter <60> for the detection of Burkholderia cepacia complex (Bcc) members in non-sterile products became official in December 2019. This isolation method requires to confirm the identity of any growth found on Burkholderia cepacia Selective Agar (BCSA) by additional identification tests (refer to the Interpretation section). This article presents a singleplex PCR method to rapidly confirm the membership of any microbial grown on BCSA (& other nutrient medium) in the Bcc group. This method is cost effective as it does not require expensive equipment nor reagents; therefore, it can be easily adopted in the industry. We validated this singleplex PCR Bcc identification method with previously published PCR primers with an expanded panel of 37 clinical and environmental Bcc isolates. The sources and repositories of these Bcc isolates include contaminated health products and medical devices, patients infected with cystic fibrosis, the National Microbiology Laboratory (NML) internal bank and the American type culture collection (ATCC). All 37 isolates that belong to the Bcc have been tested positive using our confirmatory identification method. Twenty-two negative controls including 4 isolates belonging to the genus Burkholderia have been tested negative as expected. Our work indicates this singleplex PCR is an efficient confirmatory method for a Bcc identification, and it can successfully supplement USP chapter <60> in Bcc isolate identification found in pharmaceutical products.
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