清晨好,您是今天最早来到科研通的研友!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您科研之路漫漫前行!

Improved initial guess for minimum energy path calculations

能量(信号处理) 路径(计算) 计算机科学 数学优化 算法 数学
作者
Søren Smidstrup,Andreas Pedersen,Kurt Stokbro,Hannes Jónsson
出处
期刊:arXiv: Materials Science 被引量:6
标识
DOI:10.1063/1.4878664
摘要

A method is presented for generating a good initial guess of a transition path between given initial and final states of a system without evaluation of the energy. An objective function surface is constructed using an interpolation of pairwise distances at each discretization point along the path and the nudged elastic band method then used to find an optimal path on this image dependent pair potential (IDPP) surface. This provides an initial path for the more computationally intensive calculations of the true minimum energy path using some method of choice for evaluating the energy and atomic forces, for example by ab initio or density functional theory. The optimal path on the IDPP surface is significantly closer to the true minimum energy path than a linear interpolation of the Cartesian coordinates and, therefore, reduces the number of iterations needed to reach convergence and averts divergence in the electronic structure calculations when atoms are brought too close to each other in the initial path. The method is illustrated with three examples: (1) rotation of a methyl group in an ethane molecule, (2) an exchange of atoms in an island on a crystal surface, and (3) an exchange of two Si-atoms in amorphous silicon. In all three cases, the computational effort in finding the minimum energy path with DFT was reduced by a factor ranging from 50 % to an order of magnitude by using an IDPP path as the initial path. The time required for parallel computations was reduced even more because of load imbalance when linear interpolation of Cartesian coordinates was used.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
2秒前
scm完成签到 ,获得积分10
22秒前
现实的俊驰完成签到 ,获得积分10
23秒前
25秒前
28秒前
心静自然好完成签到 ,获得积分10
45秒前
46秒前
小蘑菇应助科研通管家采纳,获得10
54秒前
Ava应助科研通管家采纳,获得20
54秒前
宇文非笑完成签到 ,获得积分0
1分钟前
Eri_SCI完成签到 ,获得积分10
1分钟前
雨后完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
Benhnhk21发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
黑大侠完成签到 ,获得积分10
1分钟前
景宛白发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
善善完成签到 ,获得积分10
2分钟前
wjx完成签到 ,获得积分10
2分钟前
阳炎完成签到,获得积分10
2分钟前
NexusExplorer应助紧张的海露采纳,获得10
2分钟前
2分钟前
zh完成签到 ,获得积分10
2分钟前
完美世界应助紧张的海露采纳,获得10
2分钟前
2分钟前
2分钟前
zheyu完成签到,获得积分10
3分钟前
bo完成签到 ,获得积分10
3分钟前
懵懂的毛豆完成签到,获得积分10
3分钟前
葫芦芦芦完成签到 ,获得积分10
3分钟前
Benhnhk21完成签到,获得积分10
3分钟前
3分钟前
3分钟前
善良的剑通完成签到 ,获得积分10
3分钟前
hwen1998完成签到 ,获得积分10
3分钟前
拼搏问薇完成签到 ,获得积分10
4分钟前
4分钟前
asdwind完成签到,获得积分10
4分钟前
高分求助中
Applied Survey Data Analysis (第三版, 2025) 800
Narcissistic Personality Disorder 700
Assessing and Diagnosing Young Children with Neurodevelopmental Disorders (2nd Edition) 700
The Elgar Companion to Consumer Behaviour and the Sustainable Development Goals 540
Images that translate 500
Transnational East Asian Studies 400
Mapping the Stars: Celebrity, Metonymy, and the Networked Politics of Identity 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 计算机科学 化学工程 内科学 复合材料 物理化学 电极 遗传学 量子力学 基因 冶金 催化作用
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3843282
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3385530
关于积分的说明 10540738
捐赠科研通 3106138
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1710890
邀请新用户注册赠送积分活动 823818
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 774308