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Least Absolute Shrinkage and Selection Operator-Based Prediction of the Binding Constant of p-Sulfonatocalix[6]/[8]arenes with Alkaloids

收缩率 化学 选择(遗传算法) 绝对(哲学) 常量(计算机编程) 数学 操作员(生物学) 人工智能 计算机科学 统计 哲学 神学 抑制因子 基因 转录因子 程序设计语言 生物化学
作者
Yu Yin,Zhen Yang,Na Li,Xuan Yu,Meiling Chen,Meng Wang,Xiaoliang Ren
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
卷期号:64 (2): 359-377 被引量:1
标识
DOI:10.1021/acs.jcim.3c01272
摘要

p-Sulfonatocalix[n]arenes (SCnA) have demonstrated great potential for drug encapsulation through host-guest complexation to improve solubility, stability, and bioavailability. In this study, the solubilization effect of SCnA (n = 4, 6, 8) on 95 active compounds derived from traditional Chinese medicine (TCM) was investigated. Based on the significant solubilization effect on alkaloids, SC6A/SC8A and 76 alkaloids were selected as the host and guest, respectively, to determine the binding constant by competitive fluorescence titration. LASSO regression was adopted to investigate the mechanism of the complex of SCnA with alkaloids. The binding constant of alkaloids-SC6A and alkaloids-SC8A was related to the alkaloid alkalinity. Also, the electronegativity, polarization, first ionization potential, hydrogen bond potential, the molecular size, and shape of alkaloids are critical properties to determine alkaloids-SC6A binding constant as well as electronegativity, polarization, hydrophobicity, and the molecular size and shape of alkaloids play an important role for the alkaloids-SC8A binding constant.
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