Prediction of bioactive compound activity against wood contaminant fungi using artificial neural networks

解淀粉芽孢杆菌 生物杀虫剂 多粘菌拟杆菌 内生真菌在植物防御中的应用 生物 抗真菌 生物活性化合物 拟青霉 植物 细菌 食品科学 化学 生物技术 微生物学 杀虫剂 发酵 农学 遗传学
作者
Henrique Vicente,J. Carlos Roseiro,José M. Arteiro,José Neves,Ana Teresa Caldeira
出处
期刊:Canadian Journal of Forest Research [NRC Research Press]
卷期号:43 (11): 985-992 被引量:13
标识
DOI:10.1139/cjfr-2013-0142
摘要

Biopesticides based on natural endophytic bacteria to control plant diseases are an ecological alternative to chemical treatments. Bacillus species produce a wide variety of metabolites with biological activity like iturinic lipopeptides. This work addresses the production of biopesticides based on natural endophytic bacteria isolated from Quercus suber L. Artificial neural networks were used to maximize the percentage of inhibition triggered by the antifungal activity of bioactive compounds produced by Bacillus amyloliquefaciens. The active compounds, produced in liquid cultures, inhibited the growth of 15 fungi and exhibited a broader spectrum of antifungal activity against surface contaminant fungi, blue stain fungi, and phytopathogenic fungi. A 19-7-6-1 neural network was selected to predict the percentage of inhibition produced by antifungal bioactive compounds. A good match among the observed and predicted values was obtained with the R 2 values varying between 0.9965–0.9971 and 0.9974–0.9989 for training and test sets. The 19-7-6-1 neural network was used to establish the dilution rates that maximize the production of antifungal bioactive compounds, namely, 0.25 h −1 for surface contaminant fungi, 0.45 h −1 for blue stain fungi, and between 0.30 and 0.40 h −1 for phytopathogenic fungi. Artificial neural networks show great potential in the modelling and optimization of these bioprocesses.
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