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Insights from the molecular docking analysis of gambogic acid with the Chikungunya spike glycoprotein E2

基孔肯雅 藤黄酸 生物信息学 对接(动物) 化学 病毒学 虚拟筛选 病毒 生物 计算生物学 生物化学 药物发现 医学 体外 基因 护理部
作者
Sadia Raheez Qamar,Amna Syeda,Md Amjad Beg,M. Irfan Qureshi
出处
期刊:Bioinformation [Biomedical Informatics]
卷期号:19 (5): 525-530
标识
DOI:10.6026/97320630019525
摘要

Chikungunya fever is a mosquito-borne disease caused by the chikungunya virus (CHIKV) and has drawn substantial attention in recent years. So far, no effective treatment is available in the form of drugs or vaccines. In this study, we aimed to screen some drugs against the pathogenic Chikungunya virus through a molecular docking approach. As a fact, the spike E2 protein plays an important role in viral attachment to the human host cell, binding to a cell receptor MXRA8. The molecules screened for in-silico interaction against MXRA8 were selected with top hit based on binding affinity. The existing intermolecular bonds were investigated further in the active site of the protein that interacts with the top-hit ligands. Gambogic acid (guttic acid) was depicted as the furthermost potential inhibitor when compared to the others it had the lowest binding affinity (-10.9 kcal/mol). Gambogic acid, as a potential antiviral agent against the spike E2 protein, could be a promising candidate.
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