亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Development and Validation of a 7-Gene Inflammatory Signature Forecasts Prognosis and Diverse Immune Landscape in Lung Adenocarcinoma

比例危险模型 肿瘤科 弗雷明翰风险评分 内科学 免疫系统 队列 癌变 生物 单变量 逻辑回归 基因 基因签名 基因表达 医学 多元统计 免疫学 癌症 遗传学 疾病 统计 数学
作者
Aitao Nai,Feng Ma,Zirui He,Shuwen Zeng,Shoaib Bashir,Jian Song,Meng Xu
出处
期刊:Frontiers in Molecular Biosciences [Frontiers Media]
卷期号:9: 822739-822739 被引量:4
标识
DOI:10.3389/fmolb.2022.822739
摘要

Background: Inflammatory responses are strongly linked with tumorigenesis and cancer development. This research aimed to construct and validate a novel inflammation response–related risk predictive signature for forecasting the prognosis of patients with LUAD. Methods: Differential expression analysis, univariate Cox, LASSO, and multivariate Cox regression analyses of 200 inflammatory response–related genes (IRRG) were performed to establish a risk predictive model in the TCGA training cohort. The performance of the IRRG model was verified in eight GEO datasets. GSEA analysis, ESTIMATE algorithms, and ssGSEA analysis were applied to elucidate the possible mechanisms. Furthermore, the relationship analysis between risk score, model genes, and chemosensitivity was performed. Last, we verified the protein expression of seven model genes by immunohistochemical staining or Western blotting. Results: We constructed a novel inflammatory response–related 7-gene signature (MMP14, BTG2, LAMP3, CCL20, TLR2, IL7R, and PCDH7). Patients in the high-risk group presented markedly decreased survival time in the TCGA cohort and eight GEO cohorts than the low-risk group. Interestingly, multiple pathways related to immune response were suppressed in high-risk groups. The low infiltration levels of B cell, dendritic cell, natural killer cell, and eosinophil can significantly affect the unsatisfactory prognosis of the high-risk group in LUAD. Moreover, the tumor cells’ sensitivity to anticancer drugs was markedly related to risk scores and model genes. The protein expression of seven model genes was consistent with the mRNA expression. Conclusion: Our IRRG prognostic model can effectively forecast LUAD prognosis and is tightly related to immune infiltration.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
4秒前
一木张发布了新的文献求助10
6秒前
多情靖易发布了新的文献求助100
9秒前
claudio12完成签到,获得积分10
11秒前
29秒前
热情的衬衫完成签到,获得积分10
32秒前
新威宝贝发布了新的文献求助10
33秒前
35秒前
从容的绿蝶完成签到,获得积分10
37秒前
多情靖易发布了新的文献求助10
39秒前
43秒前
haibao发布了新的文献求助30
47秒前
袁青寒完成签到,获得积分10
47秒前
研友_VZG7GZ应助科研通管家采纳,获得30
51秒前
1分钟前
1分钟前
wangzai发布了新的文献求助10
1分钟前
多情靖易发布了新的文献求助10
1分钟前
多情靖易完成签到,获得积分10
1分钟前
xixi完成签到 ,获得积分10
1分钟前
失眠的白云完成签到,获得积分10
1分钟前
甜蜜的紫菜完成签到,获得积分10
1分钟前
超帅曼柔完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
李健的小迷弟应助邓d采纳,获得20
1分钟前
1分钟前
1分钟前
Vintoe完成签到 ,获得积分10
1分钟前
标致访旋完成签到,获得积分10
2分钟前
可耐的萤完成签到,获得积分10
2分钟前
英俊的铭应助hhhh采纳,获得10
2分钟前
BigTong发布了新的文献求助10
2分钟前
桐桐应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
ding应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
2分钟前
2分钟前
隐形曼青应助科研通管家采纳,获得50
2分钟前
平常的丹秋完成签到,获得积分10
3分钟前
whoknowsname完成签到 ,获得积分10
3分钟前
KSung发布了新的文献求助10
3分钟前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Les chinois de jakarta: temples et vie collective 1000
Autoparametric Resonance in Mechanical Systems 1000
基于锂离子电池正极材料回收的绿色溶剂开发及工程化应用研究 800
Social Psychology 600
Cosmos as Art Object: Studies in Plato's Timaeus and Other Dialogues 600
Management and the Arts 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7645711
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9218189
关于积分的说明 19777751
捐赠科研通 7210257
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3276915
关于科研通互助平台的介绍 2438592
邀请新用户注册赠送积分活动 2274968