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基于 Illumina HiSeq 2500 测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性 分析
作者
杜文丽,
陈中钐,
许端祥,
高山,
温庆放,
sup 许端祥,
高山,
sup 高山,
温庆放,
sup 温庆放
出处
期刊:《分子植物育种》印刷版
日期:2019-01-01
卷期号:17 (2): 377-387
链接
biopublisher.cn
cqvip.com
摘要
高温胁迫时影响苦瓜作物产量及地域分布的重要限制因子,但由于其在非生物胁迫逆境方面的生物学信息研究进展较慢,这在一定程度上制约了苦瓜分子育种及品种改良工作。利用 Illumina HiSeq TM 2500 高通量测序平台对高温胁迫处理前后的苦瓜叶片进行转录组测序,结果组装获得平均长度为 700.75 bp 共 89 757 条有效 Unigene , N50 长度达到 1 239 bp ;有 48 662 条 Unigene 获得注释信息,占全部 Unigene 的 54.2% ,与未处理的对照相比,共有 2 254 差异表达基因,其中 672 个上调, 1 582 下调表达。有 27 116 条 Unigene 能够注释到 GO 数据库,获得包含于细胞组分、分子功能和生物学过程三大类内共 135 967 个 GO 的功能注释,并且差异表达基因的 GO 功能注释分类情况大致与之相似。进一步筛选到可能与高温胁迫相关的基因,包括 HSP , HSF 等家族基因。本研究是首次对高温胁迫下的苦瓜叶片转录组进行分析,为进一步开展苦瓜耐高温分子生物学层面研究提供大量参考信息。
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