Long Noncoding RNA IRAIN Drives Immunometabolic Reprogramming in Glioma via the IGF1R-JAK-STAT-BIRC5 Axis

胶质瘤 重编程 生物 转录组 长非编码RNA 癌症研究 免疫系统 调节器 小RNA 基因表达 基因 基因签名 基因表达调控 基因敲除 恶性肿瘤 基因表达谱 核糖核酸 细胞生物学 非编码RNA 基因调控网络 生物信息学 基因沉默 计算生物学 下调和上调 乙二醇 功能(生物学) 免疫疗法
作者
Ai-Shun Guo,Hong Lin,P. Charles Lin,Yuzhe Wang,Zhen-Rong Lin,Weiwei Wang
出处
期刊:Journal of Visualized Experiments [MyJOVE]
卷期号: (226)
标识
DOI:10.3791/69711
摘要

Glioma is an aggressive malignancy with limited therapeutic options and a poor prognosis. Its progression is closely linked to metabolic reprogramming and immune evasion, underscoring the need to identify molecular regulators that integrate these processes. Here, we established a robust immunometabolic-related gene (IMRG) prognostic signature and elucidated the role of the long noncoding RNA IRAIN in regulating glioma immunometabolism through the IGF1R-JAK-STAT-BIRC5 axis. Transcriptomic and clinical data from TCGA, CGGA (693/325), and GEO (GSE43378) cohorts were analyzed. Differential expression and weighted gene co-expression network analysis (β = 8) ensured scale-free topology, and a leave-one-out cross-validation framework combining ten machine-learning algorithms produced 101 prognostic models. The optimal 17-gene IMRG signature was validated across all cohorts and independently predicted overall survival. Functional assays demonstrated that IRAIN overexpression inhibited IGF1R, suppressed JAK2/STAT3 phosphorylation, and downregulated BIRC5, thereby promoting apoptosis and reducing angiogenesis. Low IRAIN expression correlated with immunosuppressive Tregs and M2 macrophages and with elevated tumor-microenvironment scores, suggesting an immune-evasive phenotype. These findings establish IRAIN as a key regulator of glioma immunometabolic reprogramming and validate the IMRG signature as a reliable prognostic tool, highlighting the IRAIN-IGF1R-JAK-STAT-BIRC5 pathway as a mechanistic bridge linking immune and metabolic dysregulation in glioma and offering potential targets for precision therapy.

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