A Network Toxicology Approach for Mechanistic Modelling of Nanomaterial Hazard and Adverse Outcomes

不良结局途径 背景(考古学) 危害 系统生物学 计算机科学 生化工程 危害分析 生物网络 风险分析(工程) 风险评估 计算生物学 生物 医学 工程类 计算机安全 可靠性工程 古生物学 生态学
作者
Giusy del Giudice,Angela Serra,Alisa Pavel,Marcella Torres Maia,Laura Aliisa Saarimäki,Michele Fratello,Antonio Federico,Harri Alenius,Bengt Fadeel,Dario Greco
出处
期刊:Advanced Science [Wiley]
卷期号:11 (32) 被引量:22
标识
DOI:10.1002/advs.202400389
摘要

Abstract Hazard assessment is the first step in evaluating the potential adverse effects of chemicals. Traditionally, toxicological assessment has focused on the exposure, overlooking the impact of the exposed system on the observed toxicity. However, systems toxicology emphasizes how system properties significantly contribute to the observed response. Hence, systems theory states that interactions store more information than individual elements, leading to the adoption of network based models to represent complex systems in many fields of life sciences. Here, they develop a network‐based approach to characterize toxicological responses in the context of a biological system, inferring biological system specific networks. They directly link molecular alterations to the adverse outcome pathway (AOP) framework, establishing direct connections between omics data and toxicologically relevant phenotypic events. They apply this framework to a dataset including 31 engineered nanomaterials with different physicochemical properties in two different in vitro and one in vivo models and demonstrate how the biological system is the driving force of the observed response. This work highlights the potential of network‐based methods to significantly improve their understanding of toxicological mechanisms from a systems biology perspective and provides relevant considerations and future data‐driven approaches for the hazard assessment of nanomaterials and other advanced materials.
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