Systematic identification of single transcription factor perturbations that drive cellular and tissue rejuvenation

返老还童 转录因子 细胞生物学 生物 重编程 抄写(语言学) 细胞 基因表达 转录组 基因表达调控 细胞周期 细胞模型 车站3 计算生物学 衰老 基因 DNA结合蛋白 遗传学 模式生物 细胞衰老 转录调控 生物发生
作者
Janine Sengstack,Jiashun Zheng,Turan Aghayev,Gregor Bieri,Michael Mobaraki,Jue Lin,Changhui Deng,Saul Villeda,Hao Li
出处
期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [Proceedings of the National Academy of Sciences]
卷期号:123 (2): e2515183123-e2515183123
标识
DOI:10.1073/pnas.2515183123
摘要

Cellular rejuvenation through transcriptional reprogramming is an exciting approach to counter aging. Using a fibroblast-based model of human cell aging and Perturb-seq screening, we developed a systematic approach to identify single transcription factor (TF) perturbations that promote rejuvenation without dedifferentiation. Overexpressing E2F3 or EZH2, and repressing STAT3 or ZFX, reversed cellular hallmarks of aging—increasing proliferation, proteostasis, and mitochondrial activity, while decreasing senescence. EZH2 overexpression in vivo rejuvenated livers in aged mice, reversing aging-associated gene expression profiles, decreasing steatosis and fibrosis, and improving glucose tolerance. Mechanistically, single TF perturbations led to convergent downstream transcriptional programs conserved in different aging and rejuvenation models. These results suggest a shared set of molecular requirements for cellular and tissue rejuvenation across species.

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